跨部门政策委员会（NSC/IPC）
副 部长级委员会的下属机构包括各种跨部门工作小组，称为跨部门政策委员会。这些跨部门委员会是由各部门和机构的实体专家和高级官员组成，作为副部长级委员会 的代表。尽管受到部长级委员会和副部长级委员会工作组对政策事务控制的限制，但从历史上看，跨部门政策委员会之类的委员会是跨部门协调的主要机构。这些工 作小组开展日常的跨部门分析、生成行动方案、制定政策、进行协调、确定资源，以及监督规划政策的落实等。有时，事件可能会影响这个传统的角色，特别是危机 情况或其他高层次国家安全发展问题受到部长级委员会或国家安全委员会高度重视时。
根 据有些跨部门政策委员会的职责范围，他们可以定期召开会议（每周，在危机情况中甚至每天几次），而其他时候只是在制定或规划需要政策同步时才召开会议。当 他们涉及到多个政府机构，还要负责管理国家安全政策的制定和实施。跨部门政策委员会提供对政策的分析，供国家安全委员会体制的更多高级委员会考虑（例如副 部长级委员会和部长级委员会），并确保及时响应由总统做出的决定。在政策制定和执行中，每个跨部门政策委员会作用会根据副部长级委员会和部长级委员会赋予 的权力和职责数量情况而定，某一届政府往往不同于另一届政府。在奥巴马政府中，跨部门政策委员会要尽可能找到共识，然后把升格的议题提交给副部长级委员 会。这些跨部门政策委员会可以围绕地区性事务或职能性事务进行组建。
（二）协调层
美国国家安全政策产生的流程本身就是一个相互妥协、利益平衡，以期达到最佳效果的过程。所以，在美国国家安全体制的运行之中，协调各方利益就显得非常突出。就目前的体制而言，其协调层面包括国家安全顾问及其直接领导下的国家安全办公机构（National Security Staff）。
1、国家安全顾问
1953年，艾森豪威尔设立了负责国家安全事务的总统特别助理，即通常被称为的国家安全顾问。国家安全顾问比较特殊，他不是一个正式的职称也不是决策者，而是总统决策体系的中枢。在国家安全事务的管理过程中，总统极度依赖其国家安全顾问来承担大量的具体工作，从而为自己提供支持。其 职责，一是作为国家安全决策过程中的“中间介”，他可建议总统召开国安会，提出各项应该受注意或深入讨论的议题，并将会议最终成果呈请总统批示；二是向总 统提供不受部门利益所左右的独立性政策建议；三是承担各项情报、信息的汇编；四是监督政策的执行；五是代表总统参与对外谈判者或进行危机处理。在大多数情 况下，由国家安全顾问负责协调国家安全委员会系统内的各个委员会。
因此，为了有效发挥作用，国家安全顾问必须得到总统、国家安全事务相关部门和机构负责人、政府机构实体专家、大量外国领导人及其政府部门、国会两党和新闻媒体的信任，加强合作而不是在各种利益相关方之间进行竞争，担负着重要的协调职责。
2、国家安全办公机构
由国家安全顾问领导的国家安全办公机构则负责国家安全委员会系统的日常具体工作。该办公机构由数百名教授、军人、外交官组成，其中一部分直接受雇于国家安全委员会，另一部分则是从其他部门借调或只是顾问。目前办公机构的人员数量大约有320人，其中大约有175个政策职位和其余保障性职位（包括白宫情况室配备约35名值守军官和35名技术/通信人员）。然而，在审查政策议题时，如果有需要，国家安全委员会及其成员同样能够依靠前国安会成员网络、职员和其他可信的政策专家。其组织结构如图2所示：
该办公机构最初的任务只是帮助筹备各种决策会议。如今，该办公机构的任务已演变成 进行有助于总统综合考虑各个委员会提出意见，做出决策的各项研究，其具体职责包括：一是负责协调各项政策的策划并监督实施；二是政策评估并完善各项国家安 全计划；三是充当顾问作用；四是收集整理各个行政部门意见并规范化处理；五是充当总统私人办公室职能；六是汇总情报界提供的基本信息。[20]
由于国家安全顾问和国家安全办公机构直接为总统工作，所以国家安全办公机构的职责和活动范围很广。虽然国务卿和国防部长都是内阁级的官员，属于正式的国家安全委员会，但他们无权凌驾于国家安全办公机构。
