自主招生的制度初衷是为唯分数论的高考制度纠偏，十年之间自主招生为高校输送了很多具有学科特长和创新潜质的优秀学生，但另一方面，在一些高校里，自主招生却成了寻租通道。
这些年，倒在自主招生的腐败利益下的高校官员并不少，自主招生的权力异化再次证明了，哪里有不受控制的权力，哪里就有腐败。其实，从本质意义上讲，自主招生并不是一种权力，而在行政化办学而不是市场、社会办学的背景下，才沾染上了权力习气。如果高校以市场化为导向办学，那么营利性应是其办学目的之一，公开透明的赞助费、择校费等费用的收取显得名正言顺，另一方面为保持竞争力，吸引优学生入学以提高高校竞争力也是其招生的必然选择。如此之下，价高者得和择优录取就是并行不悖的办学手段，不与行政挂钩，规范透明的自主招生也就没有了滋生寻租的空间。
但是，在中国，高校基本上均为公立性质，行政管理的方式使得高校成为自主招生过程中唯一有主导权的一方，自主招生才变成了一种选择学生的权力。在自主招生过程中，一是此项权力的自由裁量空间非常大，选谁不选谁往往一两个领导就能说了算；二是由于高校的自我封闭环境和官僚式的管理方式，指标不公开、报送不披露、择人过程暗箱操作。
但是限制权力以及公开透明只是治标的手段，从治本的角度来说，让自主招生和权力脱节，使其回归到办学手段上才能让其彻底失去异化的可能和空间。也就是说解决自主招生腐败需要推进高校的市场化、社会化改革，不打破高校行政化壁垒，建立现代大学制度，自主招生必然因其权力属性而必然存在异化和寻租的可能。未来高校在市场化的竞争中唯有靠高校科研能力、学生就业率等指标才能获取生存发展空间之时，自主招生才能成为任人唯贤的择才手段。
