与之相对的是，一些实力较强的地区却显得相对滞后，一反“经济基础决定上层建筑”的规律。
“现在沉默得可怕。”浙江省一位参与改革的官员坦言，“我们也希望快一点儿。但是听到一种说法是‘机构改革，以慢会快’。现在要先看周边的江苏和上海怎么出方案。”
就像是彼此之间达成了某种默契，公开视野里的江浙沪三省份的改革在前半年内迟迟未见大动静，直到9月下旬，几乎同步发力。9月24日，江苏省公布省食药局“三定”方案。27日，浙江省任命了新组建的省食药局领导班子。而上海市的“三定”方案尚未公布，但一再强调快了，快了。
“改革碰到的最大障碍就是利益问题。”国家行政学院教授许耀桐对此并不意外，发达地区往往市场监管部门比较强势，一些利益格局已经相当稳固，地方政府要推动改革就必须拿出壮士断腕的勇气。
另一个值得关注的现象是改革传统，似乎历次改革跟得紧的省份，本轮进展也会比较顺利。2010年，为统筹协调各监管部门，国务院专门设立了食品安全委员会办公室。随后，河北、河南等7个省份参照中央的做法把食安办设在了省政府，其余各省只是将其挂靠在卫生、药监、工商甚至经贸委等部门。现在看来，凡是把食安办设在省政府的，机构改革中的协调难度相对较小。
另一个重要的先期改革是2011年10月国务院办公厅下发的第48号文件，核心是取消工商、质监省级以下垂直管理，改为地方政府分级管理体制。但该文下发当年，全国仅陕西省遵照执行。
“现在大部分省区的工商、质监还是垂直管理，地方政府在改革中动不了这两个系统的人员，无形中给接下来的市县改革增加了难度。”吉林省一位参与改革的官员对南方周末记者分析道。
“触动利益比触动灵魂还难”
改革进展顺利的原因都是相似的——“因为省主要领导高度重视”，改革进展缓慢则各有具体理由。
南方某省表示，“在等着省食药局领导班子任命，领导来了，改革就加速了……”辽宁的解释是，适逢该省召开全国运动会。省政府讨论决定在全运会期间，仍然按照分段管理，保障食品安全，以防出现衔接不到位的情况。
而许耀桐教授还是从历次机构改革中看出了相似的矛盾，“有的慢不是条件不成熟，而是拖着不干。”不少受访官员在谈及核心矛盾时，都会不约而同地引用国务院总理李克强在谈到改革攻坚期时的那句话“触动利益往往比触及灵魂还难”。
机构改革的焦点之一是编制。目前多数省份提出，编制总数不能增加，新增职能只能从其他部门划转编制来履行。然而，无论是从工商还是从质监划转，都并不容易。
