常言道，人过三十不学艺，而胡晓峰当时已经40岁。选择去国防大学，就意味着放弃自己的学术专长，放弃长期的研究积累，放弃稳妥的发展前景，一切从头开始。面对“半路出家”的抉择，他一度很矛盾，但最终还是服从上级命令，投身到这次全新创业中去。
胡晓峰是恢复高考后的第一批军校大学生，先是学数学，大三时成为钱学森所创立的国防科技大学系统工程与数学系的首批30名学员之一。也正因如此，系统工程的理念从一开始就被应用到这套系统的研发中。
几年的艰苦攻关，胡晓峰带领团队研发了国内规模最大的诸军兵种联合作战“砺剑”系列战役指挥训练模拟系统。随后，这套系统在某军区进行的战区级别网上战役演习中大显身手，而这是全军的第一次，受到参演指战员的高度评价。
小试牛刀后，胡晓峰没有闲着。他知道，战略演习一直是发达国家最注重的演习，也是进行战略决策的重要依据，而战争模拟不可能没有战略模拟。然而长期以来，由于缺乏相应技术手段，我军一直没有开展战略演习，战略演习一度是“纸上谈兵”，严重制约了战略训练水平的提高。
可是战略涉及到政治、经济、军事等一系列问题，计算机怎么模拟？很多人想不通，就连有些领导也觉得这是“天方夜谭”，甚至当众提出批评。回到办公室，胡晓峰满含委屈，可是责任心逼着他重新站了起来，“我一定要把系统做好！”
2002年，胡晓峰带领团队在危机预测预警系统研究中，试图找到“武力打击与民意升降”关系的经验公式，但却碰了壁。他意识到，战略系统与一般的仿真系统最大的不同是采用的方法论不同。战争系统是复杂系统，不能用传统的还原论和拉普拉斯决定论的方法去研究，而必须从复杂系统论的角度进行研究，这就必须从研究战争的基础科学理论入手。随后，他提出了“作战实验体系”和“战争工程：走向信息时代的战争方法学”等原创性观点和理论，引起学术界的强烈反响。
