公众对自主招生改革的前景充满疑虑，担心推行自主招生改革会进一步剥夺贫困学生、底层学生进名校的机会，制造招生腐败、加剧高考不公平。中国当前实行的自主招生，简单地说，是半吊子改革，由于改革不彻底，使自主招生变异为自主腐败。
中国从2003年起实行高校自主招生改革试点，自主招生一路走来社会质疑不断，根源在于程序设计并不合理。这些高校的自主招生是与传统的集中录取相嫁接的，获得自主招生资格的学生只是获得录取优惠，还要参加高考、填报志愿，这本质不是自主招生。真正意义的自主招生是学生和学校双向选择，一名学生可以获得多张大学录取通知书再选择大学，由此建立高等教育市场竞争机制。自主招生运作10年来，并没有改变单一的分数评价体系，也没有减轻学生的负担，反而增加了招生不公的焦虑。
中国高校的教育腐败、学术腐败和社会上的腐败一样，都因权力缺乏监督。在招生方面，行政权力可以介入招生，且不受制约，这无疑会滋生权钱交易。而建立现代学校制度，就是限制行政权干预学术、教育，同时，要求行政部门必须对师生负责。这一制度，就是明晰举办者、办学者、教育者、受教育者权责的制度，让学校回归到教育家治校，而非行政治校。
推进教育去行政化，建立现代学校制度，是3年前就颁布的国家教育规划纲要明确的改革内容，但改革并未得到落实，政府不愿放权给学校，学校行政不愿放权给教师、学生，出于利益而非教育，捍卫目前的行政治校格局，从中制造权力寻租空间，蚕食教育。因此，针对自主招生改革中存在的问题，不是要求取消自主招生，而应该打破既得利益的阻力，坚定推进高校去行政化改革，深入推进真正意义的自主招生，实现教育公平。
