1654 年，乌克兰哥萨克起义军通过《佩列亚斯拉夫协议》与俄国结盟，接受俄国沙皇的保护，然而这段历史后世却被俄国篡改为“乌俄合并”的事件
匪夷所思的是，如此重大历史意义的协议正本竟然已经丢失了，更有甚者，按照俄罗斯古文献家彼得．沙夫林的考证，连副本也有可能是沙皇伪造的！因此，俄罗斯和乌克兰对于协议的内涵分歧严重，在沙俄-苏联时代，“这是两个斯拉夫民族的重新合并，乌克兰人民许多世纪以来一直渴望与俄罗斯重新合并，如果没有合并，乌克兰民族不可能得到拯救”是不容辩驳的主流观点，但苏联解体之后，乌克兰学者更倾向认为这只是一个临时性的军事同盟条约。双方各执一词，反正是死无对证。
不管怎样，结盟之后俄国如约出兵对波兰开战，挽救了岌岌可危的盖特曼政权。1667年和1686年俄国两次与波兰签订条约，将基辅与第聂伯河以东的土地并入了俄国，乌克兰人在莫斯科统治下的日子开始了。
乌克兰人很快就发现，这是“乌克兰国家的严重错误和战略失策，导致乌克兰人失去了国家和民族独立”。莫斯科并不是解放者，只不过是以“俄罗斯化”代替了“波兰化”。沙皇逐步取消了哥萨克人的自治权力，取而代之的是与俄罗斯本土完全一致的行省体系；“乌克兰”的名称遭到禁止，被更加政治正确的“小俄罗斯”代替；乌克兰语被视为俄语的一种方言（两者互通），禁止乌克兰语文艺演出，也禁止学校教授乌克兰语。许多乌克兰（尤其是东部）精英逐渐被同化。最典型的就是沙皇亚历山大一世的得力助手维克多．科楚别伊。他说:“尽管我生来就是个‘一簇毛’（当时对乌克兰人的蔑称），但我比任何其他人都更加是个俄罗斯人”。就连乌克兰最伟大的民族诗人塔拉斯．舍甫琴科的知名度也远不如同时代的乌克兰作家果戈理，后者用俄文撰写的《钦差大臣》、《死魂灵》等作品被列入经典俄语文学名著的行列，本人甚至通常被（不正确地）视为俄罗斯人。
