青岛是中国海洋科学研究最集中的城市，海洋科研力量一度佔到全国的60%、70%。近年国内海洋研究机构如雨后春笋出现，原本海洋研究机构的北京大学、清华大学、浙江大学、上海交通大学都成立了专门的机构。青岛依然佔到一半的海洋科研力量，承担了50%的国家重点海洋科研项目，是国家海洋研究人才最集中、设施最齐全的城市。
由于深海基地定位是一个公共平台，落户青岛离用户最近，与使用它的科研人员和机构最近，服务最方便。2011年，山东半岛蓝色经济区建设正式上升为国家战略，其龙头城市青岛通过积极争取，最终使深海基地落户“蓝色硅谷”核心区。
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