2013年4月10日，台湾与日本签署台日渔业协议。
大公网军事讯 香港中评社9月27发表评论文章：两岸应在东海南海问题上寻求更大合作。文章称，无论是东海问题还是南海问题，台湾当局的表现均差强人意，台湾至今不与大陆合作，在维护老祖宗留下的基业上不积极，让大陆民众颇为失望；关键是两岸不能对立，让外人看笑话；文章也提及，在和声索国谈有关问题时，大陆应允许台湾参加，让其机会向国际社会表达声音。全文如下：
一、东海问题上台当局不愿与大陆合作留下遗憾日本政府去年9月11日将钓鱼岛“国有化”后，中国大陆提出一系列的反制措施，防止钓鱼岛这个中华民族领土的丢失。这场中日钓鱼岛端尚未结束，这实际上是关系到领土主权的大是大非问题，看看两岸能不能团结，有没有决心，有没有智慧，有没有能力，共同应对这场考验。
东海问题实际上就是中日钓鱼岛争端，东海问题上两岸合作实际上就是两岸在钓鱼岛问题上合作、协调立场。去年，中日钓鱼岛争端发生后，马政府总体处理表现强差人意，留下对外示弱及有点拆大陆墙角的印象。
台湾地区领导人马英九针对钓鱼岛问题虽然发出了“寸土片石，在所必争”的誓言，但在实际行动上，至今为止还没有什么针对日本不法行为的有力的举措，最大的动作是与日方签订日台渔业协议，只争渔权，不敢争主权。给外界的感觉是，马政府总还是担心保钓会影向台日特殊伙伴关系，因而更多的行动是向日方发出友好和平的信息。
大陆国台办针对钓鱼岛局势，提出“两岸在民族大义面前应一致对外”及“两岸共同维护中华民族整体利益”的呼吁，但至今没有得到台湾的很好回应，台湾当局更多的是考虑台日关系的稳定及发展，考虑的是台湾自身利益。
针对日本政府将钓鱼岛国有化的新情势，台当局高层心理异常复杂。凡事谨小慎微的马英九先是提出不痛不痒的“东海和平倡议”行动纲领回应，该倡议分“和平对话、互惠协商”及“资源共享、合作开发”两阶段，建议中国大陆、日本、台湾从三组三边对话到一组三边协商。马英九表示，台湾与日本已进行16次渔业协定谈判，还要谈第17次，台日也有合作基础。他说，重点在于如何扩大这些合作基础。政府前提非常清楚，我们要提资源共享，但不影响主权主张，我们搁置争议，把焦点放在资源，重点就是希望国际争端和平解决。
马政府最重视的是渔权，而不是主权。最重视的是台日关系不要受影响，担心的是台湾在钓鱼岛争端中不要被边缘化，希望在事件处理中突显台湾的“主权国家”地位。
