抗议洪仲丘遭虐杀的人群：要求彻查真相 图片来源：法新社
关禁闭之前，规定要做体检，确定身体无恙才能执行。若按正常作业，体检结果要一周才会出炉，届时洪仲丘已经退伍，因此，唯有让体检报告进度加快，洪才难逃一劫。对他恨得牙痒痒的一群魔头，找到542旅副旅长何江忠施压，非置他于死地不可。
6月27日上午洪仲丘与排长到新竹国军813医院体检，洪得知体检报告需7天后才会完成，大为放心，当场将体检收执单揉掉，还说“这样就关不到我了”，因为他原定7月6日退伍。但何江忠一通电话，改变了他的命运，这名剽悍的副旅长，未经查证，听信范佐宪和陈以人的小报告，随即打电话至医院要求体检报告务必在一天内赶出来，因此当天下午范、陈两人再带洪仲丘至医院体检，范更疑似买两袋12杯饮料“贿赂”医院的体检业务人员，以便加快移送禁闭的程序。
洪仲丘心急如焚，在等待体检报告期间，曾分别发简讯向542旅旅长沈威志、政战主任戴家有求助，以自己有轻微幽闭空间恐惧症，以及禁闭流程不合法为由，要求网开一面，但他们都不理会；另外他也打电话给母亲表达心中的恐惧，然而终究无法改变被关禁闭的结果。
洪仲丘身高172公分，体重98.3公斤，大学时曾当篮球队长，BMI值（身体质量指数）为三十三，属过胖的“高危险群人员”。但部队长官为了报复，甚至在禁闭室操课时，也不让他喝水、休息。一般人体温到摄氏40度就意识不清，但根据急诊报告，洪仲丘被送到医院时，体温飙到摄氏44度，体内弥漫性大出血，导致多重器官衰竭，被活活操死。台大医院创伤医学部主任柯文哲解读洪的病例指出，洪是死于长期剧烈运动，像马拉松中暑死亡。
7月3日洪仲丘操课时觉得身体不适，瘫倒在安全士官桌旁，当晚送医急救，为时已晚。家属要求调阅那几天在禁闭室的画面，不料却有几个片段消失。洪遭虐死的关键证物——269旅禁闭室内外16支监视镜头录影带，在案发后第一时间即应查扣，但军事检察官连这项基本动作都没做，导致269旅政战主任陈毅铭有充裕时间删除影带内容，军方直到案发后二周才封存关键录影带，甚至到7月20日陈才遭移送法办。洪仲丘姊姊洪慈庸对军方的作为相当不满，痛批：“军方是把我们当白痴吗？”
消失的80分钟影带，初步研判，有人刻意用黑布遮蔽监视器，影带画面一团黑。有趣的是，这块黑布正好标示着军方在洪仲丘案的所作所为见不得人，所以要用黑布遮蔽。那关键的八十分钟画面，家属质疑被“动手脚”，可能是关键。
洪仲丘案爆发后，军方试图大事化小，小事化无，并未在第一时间搜证、查扣相关证物，让相关嫌疑人有余裕串证、湮灭证据，如果是过去，这种事早就不了了之，但因洪家锲而不舍地要求追查，引起社会共鸣，惊动马英九，下令彻查，动作慢如恐龙的军方始展开一连串羁押行动，但已经事发近二个星期。
