杨树标撰写的专著《蒋介石传》
中央一位领导作了批示，杨树标事件被列为全国清除精神污染大案。
为此，浙江省委组成了专门的调查组，进驻杭州大学进行调查，调查组组长是省委宣传部理论处副处长雷云。雷云曾在1958年被错划为右派，经受过长期磨难。他个性正直，学养丰厚，表示：哪怕丢掉乌纱帽，也不能再制造新的冤案。他带领调查组进驻杭州大学后，召开了一个个座谈会，广泛听取杭州大学干部、教师的反映，把杨树标讲课的录音和其他材料调来，细加研究，对省纪检委整理的杨树标的20多条错误言论逐一核实。他了解到，杨树标在浙江省内机关、学校、工厂做了100多场讲座，气氛热烈，很受欢迎。讲座几乎没有任何报酬。杨树标每次外出讲课都是乘公交车或骑自行车。有一次到工厂做报告，途中公交车坏了，他为了赶时间，满头大汗跑到会场。这些细节使雷云很感动。他找杨树标面对面沟通，沟通气氛心平气和。杨树标承认，他是一个性情中人，面对广大听众，为了达到良好的演讲效果，有些能在私下里而不便在公开场合讲的话，也讲出去了，因此讲话不是百分之百正确。
经过近一个月的调查，最终结果形成调查报告，与杨树标见面。报告称：对杨的讲课、报告，很有必要作一个总的基本的估价。他讲课的基调是宣传爱国主义，引用了大量史料，又能联系群众思想实际，给人以一定的启迪和较丰富的知识，并且语言生动活泼，易为一般工人所接受。因此，主流是好的。当然，讲课中也有一些不准确、不科学、信口开河的东西，乃至出现某些错误，对此，必须给以严肃的然而是善意的批评，使其引以为戒，接受教训，不再重犯。我们认为，对于一篇文章，一堂课，一个报告，首先要看它的基本倾向是什么，如果基本倾向是好的，那就要给以肯定和鼓励，然在这个基础上指出其缺点和错误。杨树标的讲课和报告，就属于这种情况。根据上述情况，我们认为杨树标同志的讲课从总体上说是好的，他的问题，是属于思想认识问题，治学态度问题，宣传纪律问题。
杨树标听后喜出望外。在全国清除精神污染的大背景下，调查组能把报告写成这样，太不容易了！
浙江省委副书记陈法文主持会议，听取了雷云代表调查组的汇报，当场表态：“同意调查组的意见，这件事就到此为止，就此结束！”
风波过后，杨树标走上了坦途，被任命为学校教务处副处长。1988年，他评上了教授，又先后担任了校长助理、校务委员会副主任、浙江大学历史系主任等职。他撰写的专著《蒋介石传》也顺利出版，产生了不小的影响。
