《南京日报》成为一方阵地，体现出决策层在城市建设思路上的分歧。分歧不止于此。主政南京的季建业和历任南京市长一样面临着经济发展的困境，“除了城市建设能拉动经济外，南京只剩下化工产业，那是南京的纳税大户。所以南京的两个PX项目能悄然开工。”
在季建业引进石化项目卡壳时，市委书记杨卫泽将“绿色”、“文化”、“历史”而非“GDP”作为南京核心竞争力，南京取消对村镇的GDP考核，强力关停数百家污染企业。
民怨集中的除了雨污分流之外，还有砍伐梧桐树。季建业成了南京历史上砍梧桐树的第二任市长。第一位“砍树市长”王武龙于2006年因严重违纪被免职。在季建业被“双规”后，南京的梧桐树成为问题官员的标签，南京市民称“砍树的市长都没有好结果”。
因地铁三号线建设砍梧桐树引发的舆论压力是季建业未曾料到的。季建业曾经在内部会议上自我检讨，他当时并不知道移多少树，也没有想到移树会有这么严重的后果，知道后也很着急。
此前的地铁一、二号线施工时，也曾发生过大规模移树，但施工单位和媒体、公众有充分沟通，最终平稳完成。季建业并没有从这些事例中吸取经验，依然停留在小城市的逻辑中。“南京的利益远远比昆山和扬州复杂，他把中小城市的思维移栽过来，就像移栽梧桐树一样，最终的结果是移死。”
在季建业饱受非议的众多城建项目中，也有一些是代人受过。其中包括城西干道改造。这是一个锦上添花的工程，改造时机为时尚早。“这是2007年即已在论证中的项目，事后省政府也已经拨了款，前几任市长一直拖了下来。”
城西干道应该是1995年-1996年间建起来的，当时南京政府财力紧张，拿不出那么多钱，但城市交通拥堵越来越严重，所以城西干道采取逢路上跨的方式。这是最好的方式，最省钱，又能解决问题。用了十多年，城西干道尽管只有4个车道，但整个快速路部分加地面部分每天承担了机动车13万的流量，已经完全发挥了快速路通道的功能。
十多年后有领导提出，还是保护老城要紧，能不能把城西干道改成隧道。这个建议一直以来都在争议和论证中。“老季上任后，迫于民意也不想干这事，他提出内环是不是小了，是不是扩大到江东路？”
根据季的意图，设计单位做了方案，各部门还是有不同意见。季咨询城建专家，专家认为江东路在城市心脏部位，不该把那么多车辆引到那里去。专家做了合理性和可行性论证，做了模型测试，形成意见发给季建业。季看明白了，拖了半年后，市委领导要求强势推进，不仅要改造城西干道，还要改造江东路。这是专家眼中最坏的结果。
季建业被带走后，很快传出其妻被带走的消息。南京房地产开发商中盛传：“他的司机和妻子承揽工程太多，尤其是绿化工程。从扬州开始即已如此。”扬州的江都本是花木之乡，季任市委书记时，并没承担绿化工程，“事实上都被外人承包了。他那时气焰就很盛了，到扬州时放了一个气球，定下所有楼不能超过的高度。”
季建业被当地媒体人定义为“能吏”，“但自己又不干净，好多人都说他会出事。到了南京更甚嚣尘上，南京肯定比扬州难得多，各种利益涉及很深，他作风又这么硬，极其危险，所以出事都不意外。”
季建业在2012年的一次会议上自问：“本市长从昆山到扬州，说话从来是算数的，怎么到南京就说话不算数了呢？”与会亲历者说季建业当时有些“失态”，现在看来却不失为其真实写照。
