暗战
杨衢云成为遭清廷暗杀的革命领袖第一人，也开启了清廷与革命党之间暗杀之争。
尽管对于杨衢云本身的历史地位存在着诸多的争议，但是有一点可以明确，杨衢云的的确确是被清廷暗杀的革命领袖第一人。而杨衢云的被暗杀，也开启了清廷与革命党之间暗杀之争。
在法治社会，暗杀是一种违法的行为，不论是政府还是革命党，都无权直接剥夺一个人的生命。然而，当这一切被赋予了政治斗争的色彩之时，自古以来杀人偿命的古训与规则被彻底地打破。
在清廷与革命党最初的对垒中，暗杀或者说是“斩首行动”成为了清廷打击革命士气的一个利器。杨衢云的被暗杀，与他的兴中会会长头衔也存在着一些必然的关联。在李吉奎看来，清末之时，信息的传播速度与途径无法与一百多年后的今天相比。清政府对于革命党内部的情况并不是十分了解，尽管他们知道孙中山的存在，也想暗杀掉孙中山，但是此时孙中山已经去到了日本。由于此前曾与杨衢云谈判，因此清廷的判断是杨衢云是当时的革命党首要人物，通过暗杀他将给革命党带来沉重的打击，造成革命党内部群龙无首的混乱局面。
而在此时，革命党与清廷之间除了彼此对立之外，在把暗杀作为一种政治斗争手段上面，甚至还存在着合谋的说法。
典型的案例是“新加坡刺康案”的疑云。当年的清廷面对国内两大势力的挑战，其中一股是以孙中山为代表的革命派，另外一股是康有为、梁启超为代表的立宪派。清廷认为，如果孙中山和康有为、梁启超联合起来，将对清廷十分不利。面对广东的复杂形式，清廷委派李鸿章到两广担任总督，目的是通过李鸿章的介入，让孙中山与康梁之间互相制衡。最好是能通过暗杀的方式除掉两人。因此，李鸿章通过刘学询传话给孙中山进行谈判，让孙中山利用日本浪人到新加坡除掉康有为。
有说法称，孙中山答应了李鸿章的要求，但是提出了自己的条件，其一是清廷撤销对其的通缉，第二是给钱。李鸿章派出战舰与孙中山在江上会面，后孙中山担心对方设计除掉他，委派了三个日本人与李鸿章谈判。最后，李鸿章与刘学询商量后，给了三个日本人三万元大洋。1900年，康有为到新加坡避难，慈禧下令刺客侦查追杀。风声鹤唳，草木皆兵。1900年6月29日，孙中山偕日本浪人内田平、宫崎寅藏、清藤幸七郎抵达新加坡。因听到传闻，康有为向新加坡殖民当局告发了孙中山等人，称其有刺杀图谋。7月6日，宫崎、清藤二人涉嫌谋刺康有为被当地警方拘留，审讯之后将其驱逐出境，并令孙中山五年不得入其境。
有关孙中山是否真的密谋了“新加坡刺康案”或许是一个永远的谜团，但是在“刺康案”后，保皇党与革命党的合作就此结束，双方彻底走向了对立。
