当时城外枪炮声隐隐传来，宫中人心惶惶。慈禧太后在忙乱中传话处死珍妃，一时间左右太监面面相觑，不敢前往。只有崔玉贵攘臂而出，口说：“都是怂小子，看我去。”
随后，崔玉贵凶神附体似的进入幽禁珍妃的院落，把珍妃连推带提拥到井口。珍妃跪地求见老佛爷一面，崔厉声说：“没有那些说的。”一脚把珍妃踢入井中，还投下了几块大石头。
这是关于珍妃之死具体情形比较权威的记录，而在很多描摹处死珍妃的文字中，慈禧就在现场。
1929年，成立不久的故宫博物院推出了《故宫周刊》，该刊第30期曾出版了“珍妃专号”，也是该刊的唯一一次专刊。
《故宫周刊》的编辑找到了当时在世的太监唐冠卿，按他的描述，有了这样的记载：
少顷，闻珍妃至，请安毕，并祝老祖宗吉祥。后曰：“现在还成话吗？义和团捣乱，洋人进京，怎么办呢？”继语言渐微，哝哝莫辨。忽闻大声曰：“我们娘儿们跳井吧！”妃哭求恩典，且云未犯重大罪名。后曰：“不管有无罪名，难道留我们遭洋人毒手么？你先下去，我也下去。”妃叩首哀恳，旋闻后呼玉桂(崔玉贵)。桂谓妃曰：“请主儿遵旨吧！”妃曰：“汝何亦逼迫我耶？”桂曰：“主儿下去，我还下去呢。”妃怒曰：“汝不配！”予聆至此，已木立神痴，不知所措。忽闻后疾呼曰：“把她扔下去吧！”遂有挣扭之声，继而砰然一响，想珍妃已堕井矣。斯时，光绪帝居养心殿，尚未之知也。
这个版本中有慈禧和珍妃的直接对面冲突，更富戏剧性，因而在野史和文学作品中流传甚广，虽然多假借不同人物之口说出，但仍能看出是源自唐冠卿之说。只是，这个版本一直因为是一家之言而备受质疑。
且不论那些或真或假的细节描述，故宫贞顺门的那眼井是珍妃的殒命之地，这一点是确凿无疑的。
多数人对珍妃的了解，大概就以投井而死为止。实际上，她死后的事情，像生前一样跌宕。
迁葬西陵
珍妃死后一年多的时间，遗体就一直沉在井内。这时，慈禧带着满清皇室避祸西安，连自己的宫城都保不住，更不会顾及那个被弃之井下的珍妃。
珍妃后来被捞出来，据说是因为慈禧的噩梦。
清西陵文物管理处资料室研究员邢宏伟告诉记者：“传说慈禧在逃跑途中，晚上睡觉经常作噩梦，梦到珍妃来找她算账，这让慈禧非常焦虑。1901年回到北京前，慈禧就下令，让珍妃的家人把她的遗体从井里打捞出来，安葬在恩济庄。”
恩济庄墓地实际上是一处宫女墓地，珍妃虽然被掌权的慈禧太后幽禁、处死，但毕竟是妃子，安葬在宫女墓地不合礼制。她本应葬在光绪陵寝之侧。
