当“东突厥斯坦伊斯兰反对党”成势后，新疆再一次遭遇1996、1997年的暴力恐怖高峰。
1996－1997：“断桥赶汉”系列刺杀行动
22名恐怖分子怀里揣着暴力恐怖计划和暗杀名单千里奔赴各地，计划在斋月的第17天暗杀24名新疆党政干部和宗教人士，在新疆大范围内制造爆炸骚乱。
1996年5月12日6点30分，是黎明前的最黑暗时刻，70多岁的阿荣汉·阿吉和他的儿子准时出现在喀什羊肠般幽暗的小巷中。每天他都踏着人们酣然的睡梦，在这个时刻前往艾提尕尔清真寺主持太阳出来前的第一次祷告。但是这一天与所有的日子都不同，闪亮的匕首在前面等着他。
阿荣汉·阿吉和他的儿子被救了过来。身中20多刀没有死去，几乎是一个奇迹。在抓获刺杀者进行审讯时，刺杀者说出了当时的矛盾心理：既要完成任务，又因为对宗教领袖阿荣汉·阿吉的敬畏而无法下手。
新疆凡是信奉伊斯兰教的穆斯林，都知道艾提尕尔清真寺和阿荣汉意味着什么。艾提尕尔清真寺是中国最大的清真寺，具有550年的历史。它是中国伊斯兰文化的中心，主持清真寺的阿吉也被认为是最有学问最能领会宗教教义最德高望重的人。
伊斯兰反对党将这一系列暗杀活动称作“断桥”、“赶汉”，他们将反对其分裂图谋的宗教人士都划为谋杀的范围，借此斩断汉民族和少数民族之间的血肉联系。
幸运的是，新疆警方很快就找到了破获该行动的线索，斩断黑名单的暗杀行动。
1997：“2·5骚乱”重创伊宁
位于美丽的伊犁河谷的伊宁是新疆天山东部的重镇，来自世界各地的客商云集之地。
1997年2月5日上午9时许，伊宁市的大街上突然冲出一伙人，手举横幅，呼喊口号，沿伊宁市主要街道游行。如滚雪球一样，到了12时许，游行人数从100多人增至千余人。随后，手持棍棒、砖块、刀具的骚乱分子开始了他们的暴力行为。
人民医院门口一对青年夫妇被骚乱分子围住，女的被人在脸上用刀乱割乱划，连踢带踏，当场死亡，男的也被打成重伤。
一位回家探亲的战士途经前进街时，被石头活活砸死。
一位乡文化站的秘书在伊犁街街口被他们用刀捅死后，又被扔进点燃的纸堆里焚烧。
警方调查的结果表明，组织“2·5”骚乱的骨干分子是从喀什、和田分别到达伊宁的，属于东突厥伊斯兰真主党，他们到达伊宁后就走街串巷煽动群众，并让群众烧毁身份证、结婚证等政府发放的证件。
1997：爆炸再袭乌鲁木齐
事隔5年，恐怖分子再一次选择了自治区首府乌鲁木齐，并且将时间选在1997年2月25日，这一天邓小平同志的追悼会在北京举行。
炸弹被精心安放在乌鲁木齐南、北、西、东四个不同的方向，并且是在乌鲁木齐人最多最集中的地方，所有的炸弹都被定在同一时间爆炸。警方调查发现，炸弹里满满地填充着铁钉子、钢珠、螺帽、螺杆，这些东西被强烈的硝酸炸药喷射出来，威力无异于一颗颗子弹。恐怖分子的冷血和残酷让人震惊。
一位汉族父亲失去了9岁的女儿。当时他的两个可爱的女儿刚刚放学。一声巨响后，整个公共汽车的后部不见了，他的大女儿受了重伤，小女儿当场死亡。
一位维吾尔族的父亲也失去了女儿。9年过去了，这个父亲还是不能看女儿的照片，不能听别人说这件事。9年的日子再也没有快乐。
