当选为副总统
她的勤奋工作得到了菲律宾上下的一致认可。担任参议员不久，她就被任命为四个重要的经济委员会的主席。她数次当选“杰出参议员”。她还被香港一家周刊评选为1998年“亚洲最有影响力的妇女”。她的政绩吸引了一大批追随者，于是她决定参加第二次参议员竞选。
阿罗约夫人成为1995年参议员选举的“选举皇后”，所获选票不仅是当年之冠，而且超过了菲律宾建国以来任何单个候选人所获得的选票数。竞选的辉煌胜利使她雄心万丈，她开始向更高的目标———马拉卡楠宫迈进。1998年的总统选举，虽然最终结果是阿罗约夫人成为埃斯特拉达的副手，但毕竟已离总统宝座只有一步之遥。
就任总统
2000年，埃斯特拉达爆出收受赌博集团贿赂丑闻和艳史秘闻，要求他辞职的声音不断高涨
。根据菲律宾宪法，如果总统任期内由于种种原因无法完成任期，应当由副总统接任。在得到菲律宾前总统阿基诺夫人等菲政坛重量级人物明确支持后，阿罗约开始与埃斯特拉达划清界限，同时她所领导的力量党和其他两个主要在野党在宿务市组成了反对埃斯特拉达的联合阵线。军方和内阁要员先后表态支持她领导的反对派。菲律宾最高法院宣布，总统职位悬空，由副总统阿罗约宣誓就任总统。
阿罗约总统在就职演说中提出：消除贫困、打击腐败、摈弃亲属政治等等。实施这个建国方案的将是一个勤奋务实的总统和一个高效廉洁的政府。
政治成就
阿罗约接任总统后提出建立“强大共和国”的目标，在政治和外交上紧随美国，强化与美国、日本和中国的关系，在经济上采取一系列稳定社会、发展经济、增加就业、减少贫困的措施，使菲律宾社会经济发展渐有起色。
执政期间，阿罗约一方面致力于发展经济、消除贫困，另一方面采取强硬措施打击包括绑架在内的各种犯罪活动，使曾一度被称为“世界绑架之都”的菲律宾治安状况开始好转，经济也步入健康发展的轨道。
首任期间，菲律宾人民平均薪资上涨11%，外国投资增加了26%，国内罢工现象减少了一半。
