与常规潜艇相比，核潜艇的军事威慑效果也非常显著。专家分析称，一艘战略导弹核潜艇如果有12对发射管，就能携带24发洲际火箭，如果每发洲际火箭能携带5至6枚分导式的小当量核弹头。一艘核潜艇就能运载上百枚核弹，一艘核潜艇就能摧毁敌方的大部分大中型城市。即便不能在战争爆发的第一时间摧毁敌人的所有战略核潜艇，哪怕只漏掉了一艘，核潜艇都可以发动毁灭性的核报复。
《现代舰船》杂志执行主编崔轶亮表示，核潜艇比常规潜艇有更多优势。其最大的优点就是，如果设计合理，核动力潜艇可以在水下活动长达几个月。理论上核动力可以给潜艇提供无限的续航力，唯一需要考虑的就是食物供给够不够、人员能否承受、武器够不够等问题。除此之外，动力完全没有问题，想潜多久就潜多久，这一优点就使得核潜艇变成了战略武器。
“真正装备核潜艇的国家只是几个大国和海上强国，核潜艇，尤其是战略型核潜艇已经变成一种决定一个国家生死存亡的战略武器。”崔轶亮还用英国和阿根廷的“马岛战争”（马尔维纳斯群岛，简称‘马岛’，英国称福克兰群岛）来说明核潜艇在海战中的价值。
“攻击型核潜艇的威力非常巨大，在‘马岛海战’期间，阿根廷政府之所以下令攻打英国占领的马岛，是因为在战争之前，英国的撒切尔政府考虑到预算，停止核潜艇在南大西洋的巡航，而在此前英国的攻击型核潜艇会定期到南大西洋值班，这对阿根廷造成了威慑力。”
“这并不是阿根廷动武的唯一原因，却是非常重要的因素。”崔轶亮说，结果，在马岛战争开始后，英国的一艘攻击型核潜艇击沉了阿根廷的一艘远航巡航舰，这一仗打得非常成功，此后阿根廷的巡航舰再也不敢出港了。这一战例可以看出为什么核潜艇是衡量一个国家海军是否强大的标志。
带有悲情的研发和使用
核潜艇是有力的武器，但是在其发展的历史上，充满了一些悲剧意味。1963年4月，美国“长尾鲨号”核动力潜艇沉没在美国科德角附近海域，造成129人遇难，成为世界上第一艘失事核潜艇。2009年2月，英国核潜艇“前卫号”和法国核潜艇“凯旋号”在大西洋发生了相撞事故。2011年12月30日，俄罗斯一个核潜艇维修船坞29日起火，导致俄罗斯一艘Delta-IV级核潜艇外壳起火。
1968年，美国“天蝎号”在驶往加那利群岛途中，在大西洋中部沉没。尽管有说法称“天蝎号”的沉没是因为苏联击中和自身鱼雷爆炸引发的悲剧，但是另一种说法是“天蝎号”自身质量缺陷导致的沉没。
即便在核潜艇的研制期间，也会出现一些意料不到的事故。为了检验核潜艇在深海的抗压性能，需要进行深潜试验。深潜试验风险性大，20世纪60年代，“长尾鲨号”核潜艇在下潜不到200米时发生事故，致使很多人葬身海底。
崔轶亮表示，这点潜艇事故在前苏联的核潜艇上体现得更为明显。在早期，苏联的核潜艇事故非常多，与当时“赶进度”有关系，实际上前期的工作并没有做得很充分，比如好多技术装备没有吃透，引发了众多事故。
“任何机械都可能发生事故，从以上的这些实例可以看出，实际上核潜艇发生的很多事故并不是与核有关，很多事故是火灾、碰撞或者人为操作失误等引起的。随着反应堆技术和核潜艇的设计愈加成熟，不太会出现核泄漏等问题。”崔轶亮说。
海上核反应堆形成了特殊的危险性。与陆地容量比较起来，它们在一个很小的空间里操作。而且在舰船上的核反应堆发生沉没的可能性很大。此外，由于潜艇依靠核反应堆为其维护复杂的动力支持系统，因此，核反应堆经常处于不安全的环境中。相对而言，陆地上的核反应堆在相似情况下能够被关闭，而海上的反应堆不容易关闭。
