在国家行政学院公共管理教研部副主任马庆钰看来，有些机构的扩编并非完全没有道理。协调不好就增加机构的做法，不仅中国有，国外也存在。从行政学理论来说，行政组织自然而然带有扩张性，包括机构、人员、职能、支出等。“但不排除有些机构因为部门利益而扩编，这就需要编制部门认真把关了。”马庆钰说。
南方周末记者统计，到本届国务院组成之前，上一届26个国务院组成部门中，与上一届“三定”规定方案相比，至少有外交部、发改委、教育部、农业部、司法部、财政部、水利部、央行等8个部委增设了新的机构。
一些部委机构的增加，源于职能的调整充实。司法部在1998年时还只有9个内设机构，但随着统一司法考试制度的实施，以及被赋予管理法律援助及管理司法鉴定的职能，2008年司法部增加了三个内设机构，分别是司法考试司、法律援助司、司法鉴定司，2010年又增加了社区矫正局。
机构扩编的理由，大多数是为了“加强”某一方面的工作。例如2009年，为加强中国作为一个边界与海洋大国的涉外事务管理，外交部增设了边界与海洋司。2012年，为强调经济外交的作用，外交部又成立了国际经济司。2010年，在强调文化体制改革的背景下，财政部成立了文化资产管理办公室。2011年，农业部设立种子局。2012年，教育部设立综合改革司和巡视办公室。
除了国务院组成部门外，上一个五年中，国家海洋局还增设了海岛司，国家文物局设立了督查司。2010年，为加强对网络文化的建设管理，国新办成立了专司此职的九局。在“社会管理”成为热词的2012年，国务院法制办成立社会管理司。
“扩编”带来连锁反应
机构扩编会带来连锁反应，往往一个机构扩编后，相关机构也紧跟在后面进行扩编。
2012年9月，央行成立了金融消费权益保护局，意在保护“金融消费者”。央行是在2009年提出这一想法的，本意是成立一个统一的金融消费者保护机构，但遭到“三会”的抵制，最终每个部门在央行这个部门成立前后，都成立了相应机构—银监会成立了银行业消费者权益保护局，证监会新设投资者保护局，保监会成立了保险消费者权益保护局。“一行三会”都得到了扩编。
2009年，国务院通过《文化产业振兴规划》后，文化产业管理类的机构纷纷实体化。2011年7月，中编办批复成立了中央文化国有资产监督管理领导小组办公室，挂靠财政部。这一批复还特别强调，这个机构的序列排在国务院农村改革办之后。当年11月，国家统计局紧跟成立了社会科技和文化产业统计司。
比上述“横向”反应，更明显的是“纵向”反应。见到中央成立了“文资办”，北京市在2012年成立了首家省级“文资办”，并且是作为政府直属机构存在的，随后湖南、河北等省也成立了文资办。
