国宝南迁途中
装运故宫国宝的木箱
第二批文物运台，租用招商局商船“海泸号”
第二批迁台文物3502箱也挑选出来了，其中故宫运出的文物尤为重要，不仅有宋元瓷器精品和存在南京的全部青铜器，还包括全套文渊阁《四库全书》和离藻堂《四库全书荟要》。《四库全书》共七部，故宫文渊阁所藏是第一部，也是缮写得最为完整的一部。这批运走的青铜器和瓷器后来成了台北故宫的镇馆之宝。
而当时在南京的青铜器中，有一件旷世珍品“司母戊大方鼎”并没有被运走。1948年夏天，这只鼎在南京首次公开展出，蒋介石还亲临参观并在鼎前留影。中华人民共和国成立后该鼎存于南京博物院，1959年转交中国历史博物馆至今。后来有人拿这事讽刺蒋介石，说他就是把这鼎搬走了也没用，国家政权的法统“在德不在鼎”。
这批国宝运到下关码头，但桂永清再也派不出一艘军舰了。杭立武只得与招商局联系，包租了该局的轮船“海沪号”。此趟运输很顺利，无眷属抢占船舱，也无风浪和狗吠扰心，海沪轮宽敞又平稳，1949年1月9日，顺利到达基隆。
第三批运台文物,海军总司令派出军舰“昆仑号”
1949年1月28日，农历除夕，南京城细雨连绵。2000箱国宝，盖着油布，露天堆放下关码头已多日。此时交通非常紧张，连火车顶上都站满了人。杭立武找遍全城也租不到一艘商船。万般无奈下，再向桂永清求助。
是日下午，桂永清派出的军舰“昆仑号”终于抵达下关码头。但此舰另有任务，只能停留24小时，码头工人都想回家过年，不愿干活了。而得知昆仑舰将去台湾的海军总部官兵和家属们又来了，蜂拥而上，两个船舱很快被占了一个，剩下的一个，只能放下500箱文物。
杭立武再次求助桂永清，但那些人既上了船就不肯再下，整舱男女老少见桂永清上船便放声大哭。对着老部下及他们的眷属，这海军总司令“希望以国宝为重”的话实在说不出口。最后只得打开官兵卧舱，尽量容纳下所有人，文物则分别送到甲板、餐厅和医务室。
在答应给码头工发放农历新年特别奖金后，终于开始装船了。由于临时容纳了太多的人，只装上了1248箱，其他得重新运回仓库。
船已严重超载。可又有四口箱子赶到码头。文物小组的专家找到舰长，要求把这四口箱子务必装上船。可舰上已无空地可容纳了，专家再向舰长褚廉方求助，舰长二话没说，下令将官长室办公桌椅拆除，硬装了进去。
昆仑舰严重超载，且多次遇到解放军炮火，刚过长江口，突然有人发现船在往北开，朝北那是去解放区的方向。副舰长找到舰长禇廉方。禇承认他想要起义，带着文物投奔共产党。
而就在早一天的凌晨三点，一艘名为太平号的客货船，从上海开往基隆的途中，与一货轮相撞，近千人丧生，可谓东方泰坦尼克号，分析事故的原因，最重要的一条就是超载。
昆仑舰最终仍然到了台湾，但到达基隆港时，已经是2月22日。昆仑舰在海上一共航行了二十多天！
