1929年春，在红四军高级干部中发生了一场波及全军的异常激烈的争论，这时，中共中央派刘安恭到红四军工作，使问题变得更加复杂严重起来。刘安恭硬要抓住“中央来信”大做文章，指责毛泽东对抗中央，搞书记专政。主张按中央指示办，分散红军，逼迫朱德、毛泽东离开红四军。
陈毅感到很震惊。但此时的陈毅已是刚从党中央“训练班”毕业回来的，他已真诚地承认自己有调和折衷的错误倾向，“陈毅主义”虽然主观上是为了维护党内团结，但没有支持正确主张，实际上压抑了正确主张。他这次回来就是为了纠正这种错误倾向所造成的“没有从政治上指出正确路线”的不良后果。因而，陈毅表示：毛泽东所说的“陈毅主义”是非无产阶级的东西，他自己也要和同志们一起打倒这个“陈毅主义”。陈毅对朱德笑道：“这个问题我来解决，只要我检讨深刻，毛泽东定会回来的。”
朱德称赞陈毅：“豁达大度，大将风度！”
陈毅是这样说的，也这样做的。就在陈毅见到朱德的当天晚上，前委召集会议。陈毅在会上正式传达中央“九月来信”，并详细作了解释，谈了具体办法。会后，陈毅派专人把中央“九月来信”送到蛟洋给毛泽东，并附上自己一封信，促请毛泽东回前委工作。
尔后，陈毅随军南下。在江西寻邬，陈毅又去信请毛泽东回前委。11月中旬，朱德、陈毅率红四军回闽西，11月23日，红四军再次攻克汀州。
在苏家坡养病的毛泽东看过中央“九月来信”激动不已。又见陈毅披肝沥胆的信，顿觉大病痊愈，精神焕发。11月26日，毛泽东在中共福建省委巡视员谢汉秋陪同下，心情舒畅地从苏家坡到达汀州。
毛泽东与朱德一见面，一个叫老朱，一个叫老毛，两人紧紧“拥抱在一起”。朱德说：“中央来信了，你是对的，以前的意见我全部收回。”毛泽东说：“朱老总啊！我那脾气发起来吼人，你大度如海。”陈毅诚恳地向毛泽东当面作了检讨，详细介绍了上海之行，并转达了李立三对毛泽东的问候。毛泽东说：“‘八大’时因身体不好，情绪不佳，写了一些伤感情的话，还得请你陈毅海涵。”陈毅听了内心感到无比高兴，自言自语地说，革命有希望了！
11月28日，毛泽东在长汀主持前委扩大会议，讨论了红四军的整顿计划，决定召开全军第九次代表大会，深入贯彻中央“九月来信”精神，并通过有关决议案。
12月3日，红四军开赴新泉，进行“新泉整训”。朱德负责军事整训，毛泽东和陈毅负责政治整顿，主要是为“九大”准备决议案。
在新泉“望云草屋”的小厅里，陈毅协助毛泽东召开了各级、各类干部的各种小型调查会，了解问题，分析原因，研究解决办法，酝酿和草拟文件。
12月中旬，由于敌军金汉鼎部再次攻占汀州，进逼连城。毛泽东、朱德、陈毅又率红四军主力由连城新泉移驻上杭古田。前委、军委机关设在八甲村，四个纵队分别布防于周围的赖坊、竹岭、溪背、菜屋等村。在古田，毛泽东和陈毅用十多天时间召集各纵队、支队和—部分大队党代表，举行讨论会。由于战局紧迫，寒风凛凛，红四军“九大”的筹备工作正在加紧进行。隆冬寒夜，陈毅和毛泽东房里的灯光经常彻夜不灭。
1929年12月28日，这天纷纷扬扬的鹅毛雪花，飘落下来。连绵起伏的山岭、平川，披上了洁白的银装。在闽西上杭古田廖氏祠堂（祠堂又名万源堂，红军来后改为“曙光小学”）院内，人如潮涌，热闹非凡。我党我军历史上具有伟大意义的红四军“九大”会议，即著名的“古田会议”，在这里隆重举行。纷飞的大雪，为古田会议增添了庄严肃穆的气氛。
会场是一间普通的厅堂，北墙上悬挂着“中国共产党红军第四军第九次代表大会”的横幅，下面是鲜红的党旗，党旗下面并排挂着马克思和列宁的画像。主席台是两张拼在一起的方桌，桌上放了几只喝水用的陶土碗。代表们的席位就是学校的长条凳和长条课桌。为了随时准备应付战斗，代表们都背着背包进入会场。
大会由陈毅主持。陈毅首先传达了中共中央9月28日给红军第四军前委的指示信，并作了详细的解释和说明。毛泽东、朱德分别作了政治报告和军事报告。到会代表展开了热烈讨论，大家发言中提出了许多切合实际的意见。陈毅还在大会上作了反对肉刑、反对枪毙逃兵的专题发言。经过讨论和充实，会议顺利地通过了由毛泽东起草的《中国共产党红军第四军第九次代表大会决议案》，即“古田会议决议”。
12月29日，大会进行选举。毛泽东、朱德和陈毅等十一人为前委委员，杨岳彬等三人为候补委员，毛泽东为前委书记。
古田会议虽然只开了两天，但毛泽东所作的古田会议讲话，却为我党我军留下了无比宝贵的精神财富。它为中国共产党的建设，为人民军队的建设，树立了一个新的里程碑！
