制定计划 准备营救
从劫机事件一发生，以色列国防部就着手准备营救行动。7月2日下午3时，总参谋长格尔向拉宾总理和国防部长佩雷斯汇报了人质营救计划，主要内容有：
1.行动总指挥是空军司令佩雷德，地面行动指挥是伞兵司令肖姆隆准将，营救人质分队指挥是伞兵团团长乔纳圣·内塔尼亚胡中校。
2.使用6架飞机。其中，4架C-130运输机，编为1-4号机，担负营救任务；2架波音-707客机，1架是空中指挥机，营救行动实施时在维多利亚湖上空指挥，另一架是医院飞机，担负紧急救护伤员任务，部署在肯尼亚首都内罗毕国际机场。
3.突击部队共280人，编成4个战斗小组：第1小组是营救分队，模仿乌干达阿明总统的车队，直扑恩德培机场的旧候机大楼，抓捕恐怖分子和营救人质，并护送人质登机；第2小组是打援分队，火力封锁通往机场跑道的各个路口，阻击机场卫兵和其他的乌干达军队；第3小组是破袭分队，负责摧毁机场雷达、通信设备和乌干达空军战机，并负责断后；第4小组是预备队。
4.飞机加油问题。设想3个方案，分别在吉布提、恩德培机场和肯尼亚内罗毕机场。前两个方案危险性大，因此倾向于第3个方案。
5.袭击时间。情报显示，恩德培机场从3日中午至4日2时30分没有飞机起降，因此，计划在3日深夜开始行动，4日2时前结束。
6.从演练情况看，从飞机降落到人质撤离，最多不超过1小时，因此，此次行动被命名为“雷电行动”。
闪电突袭 解救人质
当以色列内阁会议7月3日下午批准营救方案时，总指挥佩雷德少将乘坐的空中指挥机和医院飞机，已经抵达内罗毕国际机场。搭载着280名突击队员的4架C-130运输机也已飞过了西奈半岛的南端（临行前拉宾交代：如果内阁不批准，所有飞机立即返航）。
4架C-130运输机都标着民航机标志，飞出西奈半岛后，飞机关闭了无线电，前后保持目视距离，贴着红海超低空飞行。
黄昏时分，编队到达吉布提附近，向右飞入埃塞俄比亚领空，继续超低空飞行。20时左右，编队到达肯尼亚上空。22时45分，编队抵达恩德培机场后，以800米的间隔开始向恩德培机场降落。此前5分钟，空中指挥机也已飞抵预定位置。
恩德培机场航空管制塔误以为这些飞机运载着劫机者要求释放的嫌犯，开启了夜间着陆指示灯和探照灯，准许这些飞机降落。4架运输机分为两组：1、2号机在旧机场着陆，3、4号机在新机场着陆。1号机刚刚停稳，第1战斗小组驾驶着冒充阿明车队的奔驰车和运兵车从飞机上开下来，只用3分钟就抵达关押人质的旧候机大楼。其他飞机以2分钟的时间间隔相继着陆。
第1战斗小组快速冲到旧候机大楼门口，干掉乌干达机场守卫后，与守卫的恐怖分子展开激烈枪战。站在门口的劫匪贝泽和女劫匪泰德曼很快被撂倒。这时，指挥塔似乎发现情况异常，关闭了机场的灯光。
突击队员冲进大厅，2名劫机者用自动步枪和手枪扫射，1名人质中弹身亡。突击队员用希伯来语喊道“卧倒！卧倒！”人质们赶紧趴在地上，2名恐怖分子显眼地站在大厅中央，被迅速击毙。1名人质因反应稍慢，被流弹打死，另1名人质负重伤。大厅内交战只用了105秒。
突击队员登上了二楼，击毙了藏在厕所里的2名劫匪，机场大楼北侧的另1名劫匪也被打死，其余3名劫匪乘着黑夜逃脱。突击队员一边给被击毙的恐怖分子拍照、提取指纹，一边组织人质撤向运输机。这时，乌干达守军开始反击，从塔台射出的火力非常猛烈。第1战斗小组用反坦克导弹和机枪还击。
23时54分，2号C-130运输机载着在枪战中受伤的突击队员和大部分人质（包括受伤人质）首先起飞，前往内罗毕国际机场。
