金门战役后赴台湾整训的国民党军201师官兵
本文摘自《晚年蒋经国：透视台湾当代历史》，九州出版社
蒋介石父子一到广州，立即向当政的李宗仁发起挑战。蒋介石以国民党总裁名义频频召开会议，并于7月16日成立了国民党中央非常委员会。这一机构为非常时期的最高权力机关，政府一切措施必须先经过非常委员会决议通过方可有效。会议推举蒋介石为该机构主席，李宗仁为副主席，阎锡山、朱家骅、居正、吴铁城、吴忠信、何应钦、张群、孙科、陈立夫为非常委员会委员，程思远、洪兰友为秘书长、副秘书长。
蒋介石本为下野总统，此番又从李宗仁手中夺回了失去的权力，以国民党总裁身份兼任非常委员会主席，再次集党政军大权于一身，真正实现了从幕后走向前台。
与非常委员会机构相适应，蒋介石还决定在台北设立总裁办公室。黄少谷奉蒋令解释设立总裁办公室的原因称：
“总裁因不能常住中央党部所在地，事实上须有少数必需人员随同办事，故成立一小规模办事机构，称‘总裁办公室’。内分数组，或从事党务、政治、经济及国防等问题之研究，或办理事务性工作。”其性质属于“总裁私人秘书机构”。1949年7月29日《中央日报》。
该机构于8月1日在台北正式办公。这是继非常委员会成立之后的又一太上机构，它的成立表明蒋介石的独裁统治又有所加强。为了彻底搞垮李宗仁与抵抗人民解放军的进攻，蒋氏父子又接连抛出两个杀手锏：
一是蒋氏父子越过代总统李宗仁直接指挥反共战争。
7月16日，蒋介石主持国民党中常会与中政会联席会议，会议决定全力保卫华南重镇——广州。
7月19日，蒋介石在黄埔召集国民党高级将领会议，继续商讨保卫广州计划。蒋经国对其父提出：保卫广州最主要的条件应在人和。
7月22日，蒋氏父子乘船抵厦门，翌日召见汤恩伯及福建省主席朱一民，并主持军事会议，决定建立以台湾为中心的东南长官公署，以陈诚为长官。该机构于8月15日成立。同时决定守住福州，巩固台湾，支持到明年春天。但是，部署归部署，行动归行动，不堪一击的福州守军朱绍良部6万余人，在中国人民解放军的凌厉攻势下溃不成军。8月17日，人民解放军占领福州。随后，毛泽东挥兵进军闽南，9月16日攻占福建沿海的最大岛屿——平潭岛。9月下旬，毛泽东又发起了漳(州)厦（门)战役，10月中旬夺取了漳厦地区。
当人民解放军夺取厦门后，对金门岛形成包围之势。
按照毛泽东的构想，要彻底歼灭国民党蒋介石集团的残余势力，特别是攻占蒋介石集团所依托的最后据点——台湾，须分三步进行。
第一步：建立一支近期可用的海、空军，争取到海上制海、制空权。
第二步：扫清台湾的外围屏障，占领攻取台湾的滩头阵地。
第三步：准备在1950年夏“夺取台湾”。《周恩来年谱》(1898—1949)第833页，中央文献出版社1989年9月版。