可多数当下生活在北京的人却不知道北京曾经深厚的历史。侯仁之做的工作正是把更古老的北京发掘、呈现出来。“西城区广安门二环路沿线有一个北京建城纪念柱，旁边有侯先生写的序文，看到这个青铜的纪念，你便知道这座城市起源于此。”王南说。
王南觉得侯仁之的很多发现还没有得到足够的宣传、重视。“我们现在都向往西方的城市文明。但当年马可·波罗来到中国，见到元大都，崇拜得五体投地，他回去宣传，引起了整个西方世界对东方的崇拜和兴趣。这就是北京曾经的城市文化，这种文化引起西方人的震撼，却不为我们当下人所知了。”
“侯先生谈金中都、元大都，貌似是在说历史，其实是在梳理整个中国的文化版图，这是非常有价值的。”
3 保护北京
“先有莲花池后有北京城”
侯仁之在发掘、研究北京城历史的同时，也十分注重北京古城的保护。上世纪90年代初，王军在《北京地图集》的新闻发布会上第一次见到了侯仁之。当时侯先生将书翻到印有北京城门的那页，激动地说：“《北京地图集》能够将北京被拆毁的城门印出来，这事真的特别好。”会后，王军跑去采访侯仁之，侯仁之对他说：“真的不应该拆城墙，北京是人类在地球表面上最伟大的工程，这个工程在西方学者看来是里程碑，是文明的顶峰，我们一定要爱护。”
也是在侯仁之的保护下，“北京最初的生命印记”——莲花池才得以保存。20世纪80年代，曾任铁道部部长的万里给侯仁之打来一个电话说，有方案建议占用莲花池，建设北京西站。侯仁之一听就说这绝对不行。他认为莲花池和北京城有着血肉相连的关系，北京城起源的蓟城就是靠着莲花池这个水源才得以存在，没有莲花池也就没有北京城。尽管它作为水源的作用已经消失，但抹杀这样一个镌刻着历史的遗迹，就是抹杀过去。
最终，在侯仁之的呼吁、奔走下，西站向东挪移了100米，莲花池得以保存。之后，侯仁之得到一个机会向北京市委领导讲述北京城的历史。侯仁之将演讲的题目定为《从莲花池到后门桥》，八十多岁的他亲自去莲花池和后门桥考察，准备了将近两个月的时间。讲座中他再次指出莲花池对于北京城成长的意义，也强调了中轴线作为北京历史见证者的地位，希望可以对莲花池和后门桥的遗址进行修复。他的建议最终得到了采纳。
但侯仁之保护古城的工作也曾遭遇不少挫折。1998年侯仁之和一些学者呼吁保护美术馆后街22号四合院。不过在坚持了两年后，四合院还是在2000年被拆掉了。王军说遇到这种情况，侯仁之总是很焦虑，“对于北京城我觉得他真的尽到了他的责任。”
侯仁之的一生其实颇为坎坷，年轻时曾因参加抗日运动而被捕入狱，“文革”十年又被批斗、挨打、游街、劳改，历经磨难。但老人却以平和之心面对一切，他曾对一生做过一个简单的总结：少年飘零，青年动荡，中年跌宕，老而弥坚。
回顾自己的人生，他说“平生最爱夕阳晚，坐听涛声到黄昏”。
