目标
是有目的的击落还是误击？
对于一架民航客机被击落，各方都表示不解。但据俄罗斯国际文传电讯社报道，俄联邦航空署匿名消息人士称，客机被乌方从地面或空中发射导弹击落，而袭击真正目标很大可能是俄罗斯总统普京。
该人士称，MH17航班在莫斯科时间15:44经过了华沙附近10100米高的空域，普京专机随后在16:21经过同一区域。此外，两架飞机在外观上非常相似，体积也差不多，两者的涂色在那么远的距离看来也是一样的。据报道，俄总统专机伊尔96-300和马航客机波音777在长度上相差8米，翼展相差4米。
对此报道，俄联邦航空署署长亚历山大·涅拉季科拒绝发表评论。他强调，“俄航空署从不公布和评论总统专机的线路信息。”
不过，俄罗斯媒体随后就对此消息进行了辟谣。据俄罗斯《报纸报》报道，伏努科沃机场3号航站楼辟谣称，普京专机并没有飞过乌克兰上空，“普京只有一架专机，他不乘坐其他飞机，专机只在伏努科沃机场3号航站楼起降，已经很久不飞乌克兰上空。”同时，《今日俄罗斯》还贴出普京专机与失事客机的对比图，推翻此前说法。
中国军控与裁军协会高级顾问徐光裕在接受媒体采访时也表示，以普京为目标可能性不是很大。因为MH17的飞行路线是向吉隆坡，飞向东南，而普京则是从拉美回莫斯科，航线本身吻合部分并不多。
客机坠毁是任何人都未曾预料到的，分析人士对于“此次灾难是一次误击”的看法比较一致。中国国际问题研究所研究员陈玉荣说，相信这不是任何一方的最初目的，任何有良知的人都不会希望发生这种悲剧。从这一角度看，这起空难应该是偶然事件。
航线
马航是为了省钱飞经交战区吗？
英国《每日邮报》17日说，马航MH17航班在乌克兰东部坠毁时所经过的空域并非管制区，但多家航空运营商曾获提醒，那片空域可能有危险。报道称，据信马航飞行员数次忽视关于避免在乌克兰上空飞行的警示，可以理解的是，这样飞比转向北或向南飞路程短，更省钱。
就马航客机在乌克兰东部顿涅茨克州坠毁，国际航空协会17日在一份声明中说：“基于现在的信息，可以相信，该飞机所经区域并非管制区域。”
然而，早在今年4月，国际民用航空组织和欧盟航空安全局就相继提出，“鉴于对国际民航飞行存在高度危险的可能性”，建议航空运营商考虑替代航线。欧盟航空安全局还提供了数条备选航线。本月14日，欧洲航空安全组织向航空运营商发布正式文件，强调这一警示，并“强烈建议”航班避开马航坠机事发地上空。这份文件被称作Notam。
《每日邮报》 援引一份名为“飞行员通知”的文件说：“英国航空运营商强烈建议，在接到下一次通知前，避开克里米亚、黑海及亚速海上空飞行。”
美国联邦航空管理局同样下令禁止美国的航班从克里米亚上空经过。
只是，多家航空运营商仍继续采用这条航线，英国航空专家诺曼·尚克斯说：“这是条繁忙的航线，曾有关于航班避开那片特殊区域的建议。但是，像其他多家航空运营商那样，马航继续采用这条航线，因为这条线路较短，那意味着使用较少航空燃料。”
马来西亚总理纳吉布18日凌晨在吉隆坡召开的新闻发布会上说，国际民航组织已经宣布在马航MH17航班的飞行路线是安全的。纳吉布同时指出，国际航空运输协会也确定MH17航班穿越的领空不属于禁飞区，而马航也确定，客机没有发出任何求救信号。马航当天发布声明说，马航所有欧洲航线航班将飞行替代航线，避免原有航线。
高度
马航MH17的飞行高度正常吗？
据天空新闻网报道，欧洲航空安全局、欧洲航空安全组织已经确认，尽管MH17航班在禁飞区上方飞行，但其只比禁飞区高304米。据报道，飞机从雷达显示屏上消失时所显示的飞行高度是33000英尺（约10058米）。
另据《华尔街日报》 报道，MH17航班坠毁事故的调查人员将就乌克兰官员本周将该国东部冲突地区禁飞高度定在32000英尺（约合9754米）的决定展开详细调查。据报道，许多地对空导弹的飞行高度都可以轻松突破40000英尺（约合12192米）。
航空安全顾问考克斯称，MH17航班当时的飞行高度只比禁飞区上限高度高出1000英尺（约合304米），但马航不应为此受到指责。他表示，如果飞机在禁飞区的上方飞行，就应该是安全的。禁飞区的高度中已经包含了安全冗余。
考克斯说，以前从来没有地对空导弹在这种高度上击落飞机，此前的威胁通常来自肩扛式导弹，这种导弹的射击高度不超过15000英尺（约合4572米）。
7月1日，乌克兰建议飞行员在飞越该地区时的飞行高度不低于26000英尺（约合7925米）。但到了本周一，乌克兰方面称，一枚俄制导弹击落了飞行在21000英尺（约合6400米）高空的一架乌克兰军用运输机，于是政府将禁飞高度提高至32000英尺（约合9754米）。
对此，美国和欧洲的航空官员表示，他们不知道乌克兰作出禁飞高度决定的原因。他们称，每个国家都可以根据自身需要发出这样的通知，而无需说明理由。