台湾陆军下士洪仲丘在军营遭虐待致死案如“一石激起千层浪”，在岛内引起强烈反应，不仅军方两度易帅，连实施了超过半个世纪的军事审判法也被大幅修改。今后在和平时期，军人犯罪不再由军事法庭审理，而交由普通司法体系处理。由于台湾捲入战事的机率微乎其微，军审法已是“名存实亡”。“立法院”这次修改军审法的初衷是希望消除坊间对军方“自家人办自家案”的疑虑，因而修法明订涉及军方的案件分两阶段全部移交地方检察署，但移送的案件中包括林毅夫“叛逃案”，不少人关注军审法变革能否为林毅夫案打开一扇窗。
林毅夫一生传奇。他原名林正谊，年轻因积极投军而成为军方重点培养对象。1979年他担任台湾军防最前线金门马山连连长时，从金门泅水渡过台湾海峡来到大陆。林毅夫后来说，台湾与大陆分离是歷史悲剧，当时选择以特殊的方式离开，不是不喜欢台湾，而是认为台湾人也是中国人，不仅学校是这样教育，家里的祖先神主牌也是清楚写?“我们是从大陆来的”。可见，林毅夫泅水登陆的举动不过是在特定歷史时期、特定时空背景之下的无奈之举。但台湾军方却以“投敌罪”通缉林毅夫，致使他至今未能返台，甚至其父逝世时也未能在旁送终。
对于台军处理林案的方式，岛内意见分歧，关键在于林毅夫是否“连续犯”。军方认为，林毅夫目前仍在大陆生活和工作，“投敌行为”仍在继续中，属于“连续犯”，只要他一天在大陆，其刑事责任就不会消失。但法界人士认为，林毅夫1979年的“逃亡行为”距今已30多年了，早已超过法律上认定的20年追诉期，即使因为罪刑重大而延长5年，还是过了追诉期。而且台湾在1991年就废止了《动员戡乱时期条款》，在法律上而言，大陆已不再是敌对地区，林毅夫何来投“敌”罪？
多年来林毅夫“有家归不得”的最大阻力就是来自台湾军方，“国防部”前部长高华柱还以头上乌纱作担保，坚持严办林案。如今林案回归普通司法机构，应可摆脱军方传统的定见，以较客观的司法角度来审视林案。尽管军方日前表示，去年与法务部达成共识，林毅夫的“投敌犯行”属于“连续犯”，犯罪追溯时效还未开始。不过，“共识”毕竟不是法律条文。如何审理林案，将考验岛内司法体系的独立、公正的精神。
