会谈“唇枪舌剑火花四射”
会谈围绕“两岸的差异与共识”等主题展开，基于不同立场，参会双方异见颇多。
开幕致词时，谢长廷就抛出两岸交流已严重失衡，引发岛内民众五大不安的看法。他滔滔不绝，还错把演讲稿当作了致词稿。中国社科院台研所所长余克礼则不赞同谢长廷所说的两岸交流严重失衡。会谈伊始，双方就“唇枪舌剑”，你来我往。
此后会谈全程闭门进行，但外界依据发言稿，仍能一窥双方思维碰撞、火花四射的场面。
谢长廷除提出两岸交流的五大不安外，也提出新的观念与新作法，他说，和平并不是没有差异，从历史看，两岸个别发展时间很长，这样的两个个体一定有差异，现在问题是如何处理差异。
谢长廷还向在场的大陆学者喊话，政党交流不应局限自己想法一样的政党为对象，正因为有差异才需要交流沟通，透过交流沟通才可以降低敌意，减少误会和冲突。谢长廷在随后的演讲中提到，积极负责、处理差异；由下而上，扩大参与；尊重现状、强化互信；立基宪法、稳定和平。
孙亚夫发言说，20多年来，一个不争的事实是，“台独”之路违背了人民的利益和愿望，违背了历史和现实，违背了两岸关系发展的潮流，是行不通的。他说，虽然两岸许多方面存在差异，但双方不能永远站在差异的两边，老死不相往来；更不能利用差异制造误解，甚至挑起对抗。相反，双方应当缩小差异，逐步消弭差异，以期破除误解，直至结束对抗，走到一起来，共同改善和发展两岸关系。
与会的民进党“立委”赵天麟对媒体表示，虽然双方言语交锋，各持立场，却能更增进彼此了解。台湾政大台湾文学研究所所长陈芳明受访时也表示，如果双方已经互相理解就不需要开会了，火花四射反而是开会的目标。
会谈也不是只有歧见，没有共识。会议结束后，双方发表三项共识：两岸关系和平发展得到两岸主流民意的支持，台湾各政党参与两岸交流将更全面反映岛内民意；两岸交流应让广大基层人民受益；两岸应面对历史、正视现实，推进政策创新，促进两岸共同繁荣发展。
