中国科学家破译牡丹基因组 “定制化牡丹”成可能

　　大公网9月26日讯（记者 冯雷）26日，河南省洛阳市政府、深圳华大基因联合对外发布，他们在世界上首次破译牡丹基因组，在国际植物基因组研究上填补了芍药科植物基因组的空白，使这个来源于中国的花卉品种在世界基因研究领域完美亮相，在牡丹研究方面具有里程碑意义。

洛阳良好的牡丹产业基础

　　“洛阳牡丹甲天下”。洛阳是内地牡丹的研究和栽培中心，有着悠久的牡丹种植历史、丰富的牡丹种质资源和良好的牡丹产业基础，开展并应用基因研究。2014年12月，洛阳市政府、深圳华大基因签署协议，共同开展洛阳牡丹基因组学研究，包括洛阳牡丹基因组测序和牡丹遗传多样性、洛阳牡丹分子育种研究，而最重要、最基础和最核心的任务是牡丹基因组测序研究。

　　据介绍，牡丹基因组极其复杂，达12.5GB（约是人类基因组的4.5倍）。华大基因和洛阳农林科学院经过近三年的协作攻关，动用包括国家银河超算在内的各种科研资源，应用世界最先进的第三代测序技术，先后完成了2.67TB二代高通量数据，1.49TB的第三代测序数据采集，结合759GB约58×的Hi-C数据组装，在世界上首次破译了牡丹基因组。

　　牡丹基因组的破译首次完成了牡丹基因组精细图的绘制，使“数字化牡丹”精彩呈现。完成牡丹基因组组装大小12.25GB，拼接片段Contigs N50=128KB，基因组完整度98%，双端比对率98.8%，锚定染色体85%的基因组精细图谱，实现了超大基因组三代测序技术的完美组装。

　　牡丹基因组的破译首次注释65898个牡丹基因，使“定制化牡丹”成为可能。获取了包含牡丹花形、花色控制基因及与牡丹籽油合成相关的基因，为精准化牡丹分子育种提供了技术支撑。

　　此外，牡丹基因组的破译首次构建了牡丹基因组及表型数据库，使“信息化牡丹”触手可及。依托研究成果建设了牡丹基因组数据库，涵盖1000余份牡丹品种资源，从基因视野对牡丹进行分类、甄别，实现大数据查询应用。

　　业内人士认为，基于此项研究成果，我们不仅可以更加科学地做好牡丹品种资源的溯源、保护工作，还可以实现牡丹精准定向分子育种，并可以加快牡丹产业化发展。