四轮“方崔大战”
关键词 转基因安全
2013年9月
崔永元发微博对转基因产品提出质疑。之后方舟子发微博称“你当然可以选择不吃，但是不要传谣阻碍中国农业技术发展”。
2013年9月13日
崔永元：当你搞不清楚转基因是什么东东，甚至“著名科普作家”用“泼皮无赖”“居心叵测”的方式给你科普你还不知是什么东东时，不吃是明智的选择。
2013年9月14日
方舟子：崔永元又开始转发反转控的谣言。
2013年11月7日
方舟子：崔永元在美国的流窜调查，揪住超市店员乱问，语言半通不通，据我了解，店员都没有听明白他要说什么，然后他就宣布美国人都没听说过转基因食品。
关键词 赴美调查
2013年12月20日
崔永元：美国人民已经“放心地”吃了近20年转基因食品——这是肘子们编造的天大的谎言……肘子及农业部肘子撒谎成性，欺骗公众。
关键词 坐拥房产
2014年1月8日
崔永元转发他人质疑方舟子在美国拥有房产的微博，称“我不认为这些钱都是肘子嗑普骗来的，肯定还有其他的骗法”。
2014年1月9日
方舟子贴出多张房产照片，称“报道说这是崔永元豪宅，不知是否属实？……哪来那么多钱”。
关键词 基金黑幕
2014年1月12日
方舟子：且不说安保资金创立时已声明为避免泄露安保细节不会晒账……晒不晒关你什么事？崔永元的公募基金倒是必须晒。
2014年1月13日
崔永元：多年以前肘子信誓旦旦公开声明会公布打假基金账目，欢迎各位监督，转眼七年了，肘子按兵不动……
方舟子答辩崔永元无道德与转基因无关
方舟子答辩称，崔永元的诉讼理由罔顾事实，混淆是非。双方间的纠纷并非方舟子恶意挑起事端，也并非因为转基因观点的不同所致，而是崔永元突破道德和法律底线使用侮辱诽谤的语言攻击答辩人引起。
崔永元所列举的方舟子对其言行的评论均不构成对其名誉权的侵害。方舟子对崔永元从事或参与的公益项目的评论或微博言论均是基于事实有根有据的合理质疑。崔永元的反诉属于恶意诉讼，本质为吞并或抵消本诉，请法院依法驳回反诉请求。
在举证质证阶段，方舟子一方提供了三组证据，其中包括微博证据和证实转基因食品安全性的证据。