无果的协调
选建在“敏感地带”
在江苏昆山方面看来，上海市青浦区将垃圾厂建在与昆山一河之隔的地方，有故意之嫌。这一带常年吹东风，垃圾厂处于上风向，昆山处于下风向，只要起风，恶臭味直扑昆山。
对于昆山的“故意”之说，上海市青浦区副区长余旭峰并没有回避。余旭峰说，青浦区将垃圾厂选建在此处，并非故意，而是“迫不得已，科学合理的”。
据其介绍，青浦区地形特殊，呈蝴蝶形状，中间是城区，两侧是青东和青西地区。青西地区是上海市水源保护地，上海市五六个区的自来水水源都来自这里，选址在那里根本没有任何可能性。青东地区靠近中心城区，有多个重点工程项目和生活区域，北侧则靠近昆山中心城区，这两处也不合适，“只能选址在青浦中部”。
“当然了，确实有故意的嫌疑，是往昆山靠，对昆山有影响。因为这里是狭长地带，又是省界。” 余旭峰说，选址在这个地方也是自加压力，因为选址在省界比较敏感，这样一来，对青浦区环保工作有更高的要求，要经得起江苏昆山环保部门甚至环保部等专业部门的检查。
尽管青浦区方面一再强调，垃圾厂选择此处是“科学合理的”，但对于昆山的居民来说，则要饱受恶臭熏染之苦。
违规建设之争
对于上海市青浦区在苏沪交界处建设垃圾处理厂，是否应该通过双方共同的上级部门——环保部审批的问题上，昆山方面认为该项目环境影响报告只通过上海市环保局的审批，根本没有上报环保部，属于违规建设。
昆山方面认为，我国在1998年出台的《建设项目环境管理条例》中对此即有明确的规定。
此外，垃圾厂隔河相对的昆山市千灯镇新泾村，是基本农田保护区，根据我国《固体废物污染环境防治法》的规定，在省级以上部门划定的自然保护区、饮用水水源保护区、基本农田保护区，禁止建设生活垃圾填埋场。
10月9日，上海市青浦区环保局局长赵宏林在回答记者提问时表示，该项目环境影响报告2003年通过了上海市环保局的审批。对于是否应该到环保部审批，赵宏林表示，暂时不能答复，等查询到相关资料后再给出答复。
青浦区副区长余旭峰则表示，这个项目肯定是有相关合法手续的，“该走的程序都会走，绝不可能在桌子底下做事情”。
“垃圾厂毕竟存在环保风险，但是这种环境风险主要针对人来讲。” 余旭峰说，“不是说边上有农田，或者对农田造成特别恶劣的影响，以后种出来的东西就不能吃。”
跨界治理的困局
自从垃圾厂运行以来，不仅昆山方面叫苦不迭，因为污染问题来自各方面的压力让上海青浦区方面也很头疼。
昆山环保多次和青浦区环保部门交涉。仅在去年，双方就面对面沟通了4次。据参会者形容，尤其是第一次沟通协调会上，双方剑拔弩张，气氛紧张。经过多次沟通协调，双方初步达成共识。
这一问题也引起了上海市和江苏省乃至国家有关的重视。
2011年7月，因恶臭污染，昆山村民赴青浦区上访，随后昆山环保局相关负责人专程赴青浦，与青浦环保局相关领导协调。
2012年9月26日，国家环保部华东督查中心对该企业现场检查时就明确指出，该企业无论从生产工艺还是管理水平，都比较落后，应做好远期规划，关停该垃圾处理厂，以底解决臭气扰民现象。
2012年10月11日，根据中央联席办、国家信访局主要领导的批示，江苏省、苏州市有关领导与上海市青浦区委领导，在昆山市千灯镇召开协调会。
2012年10月30日，江苏省环保厅陈蒙蒙厅长赴昆山调处青浦垃圾处理厂臭味污染问题，表示积极协调，继续向环保部等部门反映、汇报，推动早日解决。
然而，时至今日，该问题仍然悬而未决。
