在1987年，从马共分裂出去的黄一江等人领导的马西共也已经和平走出丛林，放下了武器。在那之后，陈平一直寻求机会回到马来西亚家乡，他曾说：“我现在年纪大了，要传达的讯息是很想回老家去拜祭去世的父母亲和死去的兄弟。”但一直未得到马来西亚政府的放行。2009年，在《合艾和平协议》签署20周年的日子，马来西亚政府对这个日子不再提起，而陈平则发了纪念献词，“三方确认，这项光荣的和解将为泰马边界地区和马来西亚带来繁荣、稳定和安全。”陈平写道，“(1)签署的这些协议符合我们党争取实现和平的政策，符合当前世界人民要求和平与民主的历史潮流，同时也符合马来西亚和泰国两国人民的利益。(2)我们认为，通过和谈达成的结束41年武装活动的上述协议是一项光荣的和解。毫无疑问，这种对各方都公平合理的和解是基于互谅互让的精神达成的。(3)我们相信，这些协议的签署将在我国历史上写下新的篇章，将对马来西亚和泰马边区的繁荣和稳定作出重大贡献。”
1989年的《合艾和平协议》是迟到30多年的和平协议，有评论认为，陈平和马共应该为1950年代的和平谈判失败负责。但原马共主席阿都拉西迪曾指出：“1955年的华玲谈判中，我们曾为争取结束武装斗争和实现和平而努力，以便共同稳固不久后将实现的独立。但是，由于各种原因，谈判终于宣告失败，武装冲突因而延续下来。” 陈平认为，“华玲会谈式的单方面压力只能带来冲突，只有在互谅互让的精神下达成的公平合理的和解，才能为国家与人民带来和平、繁荣和稳定。”
《合艾和平协议》签订后，泰南大约1188名马共成员中的约400人回到马来西亚，700多人留在泰南的4个和平村，过上了普通人的生活。对于和平村，陈平曾提过，“4个和平村基本上获得泰国王室和政府的关照，村的建设顺利进行，村民的经济和生活也相当不错。”由于失败的马共成员大部分由华人组成，马来西亚华人时至今日依然因此而成为被攻击的理由。旅居台湾的马来西亚华人作家黄锦树在《旅台、马共与盆栽境遇》一文中写道：“自(上世纪)30年代以来参与反殖、抗日斗争的历史被淡化了，被强调的倒是它的血腥形象：暴力、暗杀、反叛，也被官方视为历史的禁忌，更被族群化，与华人的不安分连结。”而关于马共，自马来西亚建国以来，作为败的一方，潜入了森林，同时也遁入历史的迷雾里。
三
陈平一生备受争议，他生前认为，必须将这如何评价的问题抛给大马人民判断，否则自己评分就沦为“狂妄”之举。他指出，历史评价的问题应该由大家评断，他没有明确为自己的行为打分。他在一次采访中说，“我想这问题由自己回答会有点狂妄，应该由马来西亚的人民来判断我的一生做了什么事情，对马来西亚有利或不利。人民自己判断，给我评价。”
对于革命和之后带来的牺牲，陈平自己也说过，“参加革命斗争是自愿，没有人强迫，这个代价很难说是什么代价。”
陈平是终身的社会主义者，他自己曾说过，“我想社会主义总会有吸引力，总是会有人跟着这条路走，这点我毫不动摇。当然在前进的道路上，有些时候发展顺利一点，有些时候则不顺利。”“我对共产主义的信仰从来没有动摇过。当然前进的道路上，共产主义总要碰上困难，面对曲折。”
