1965年9月，由于克什米尔争端，印巴之间再度爆发战争。印度军队一方面越过停火线，向巴控克什米尔地区发动进攻，另一方面又越过印巴边界，向巴基斯坦的拉哈尔地区进攻。对于印巴的冲突，中国仍然坚持不卷入的立场，但是在道义上明确支持巴基斯坦, 谴责印度军队的扩张行径。此外，中国外交部还连续3次照会印度驻华使馆，对印军侵犯中国领土的事件提出强烈抗议，要求印方拆除它在中锡边界中国一侧和跨中锡边界线上的所有工事，立即停止在中印边界和中锡边界的一切入侵活动。接到中国照会后，印度担心中国会介入印巴冲突，故很快按中方要求全部撤走它在中锡边界中方一侧的军队，并拆毁了工事。战争结束后，巴基斯坦对中国的各种支持表示了诚挚的感谢。
60年代末，美国由于长期陷入越南战争的泥潭，在与苏联的争霸中逐渐处于劣势。1969年1月尼克松就任美国总统后，将尽快从越战中脱身作为头号任务。同年8月，他亲自访问巴基斯坦，并请巴总统叶海亚·汗转告中国领导人，愿意同中国对话，改善两国关系。此后，叶海亚·汗总统在中美领导人之间多次传递口信，发挥了牵线人作用，直至促成1971年基辛格成功的秘密访华和1972年尼克松的中国之行。
1971年11月，印度借口帮助东巴人民实现民族自治，悍然对东巴基斯坦发动进攻，第三次印巴战争由此爆发。在这个问题上，中国坚决站在巴基斯坦一边，反对印度无端侵略一个主权国家。
70年代末，苏联为了扶植一个亲苏政权，派大军入侵并占领阿富汗。苏联的侵略行径遭到了国际舆论的强烈谴责。苏联侵阿不仅威胁巴的安全，也威胁中国的安全，共同的利益促使中巴联合起来反对苏联的侵略行为，也推动中巴友好关系上了一个新的台阶。在整个80年代，中国一直通过各种途径支持巴基斯坦，直至1989年苏联从阿富汗撤军。
90年代冷战结束后，尽管国际关系和南亚形势发生巨大变化，但是中巴的友谊和合作关系并没有改变，而且进一步向前发展，双方在政治、经济、贸易、科技、教育、文化和军事等领域的合作日益频繁和紧密，开始了一种全方位的合作伙伴关系。1996年12月，江泽民主席成功地访问了巴基斯坦。访巴期间，他做了题为《世代睦邻友好，共创美好未来》的演讲，提出了中国与南亚各国共同构筑面向21世纪的长期稳定的睦邻友好关系的五点主张，为未来中国与南亚各国友好关系的发展，奠定了坚实的基础。
今天，随着李克强总理对巴基斯坦的成功访问，中巴友谊必将更上一个新台阶。
