1948年英国殖民政府将马共列为非法组织，调动大批军队镇压马共，陈平被列为首号通缉犯。在英国人以多倍数量军队镇压下，马共被迫撤退到泰国边界。1955年马共由陈平、拉昔迈丁与陈田代表，与政府在华玲举行会谈，不过失败，陈平与其追随者继续坚守在马泰边界的根据地进行武装斗争。
唯一不获准回国马共
为了争取国际援助，陈平在1961年度过重重难关，通过陆路到中国，从此就在中国远端指挥森林里的战士。1981年邓小平上台后，为了维持与周边国家的关系，中国切断对马共等国外共产运动的支持，许多滞留中国的马共领袖纷纷回返马泰边界继续进行武装斗争。1989年马共与泰国及大马政府签署和平协定，结束长达41年的武装斗争，数百名马共游击队员选择回返大马定居，其他游击队员则留在边界以泰国政府拨给的土地耕作维生。
马共党员在获悉陈平去世后纷纷北上曼谷，送其老总最后一程。陈平的太太李坤华在多年前去世，陈平在曼谷是由其妻舅等亲属照顾。由于大马政府禁止陈平踏足大马，其亲属被迫在曼谷为其办理后事。陈平在生前曾致力争取回返大马定居，包括亲自写信给时任首相阿都拉，不过未获回应。陈平随后选择与政府对簿公堂，不过被法庭驳回申请。为了实现回乡梦想，他在1909年底在泰国接受媒体访问时表示，他不介意政府暗中安排他以低调的方式回国，但拒绝以公开道歉的方式来换取回国；他相信是种族主义情绪作祟，导致他成为唯一不被允许回国的马共成员。
访新加坡晤李光耀
但也曾与马共作战的新加坡，却允许陈平到访，陈平在2004年应新加坡国立大学邀请访问新加坡3天，他也获得新加坡建国领袖李光耀的接见。据陈平在大马定居的战友方山透露，他在去年底于泰国会见陈平时，陈平向他表达回返大马的心愿，他说：“陈平生前多次说过想要回国，(若本人不能回来)死后也要将其骨灰运回家乡安葬。”他表示在生时无法回返他出生及成长的家乡，是陈平最大的遗憾。
陈平骨灰欲回国的心愿显然无法在短期内实现，由于执政党巫统党选即将在下个月开始，为了赢得选举，所有领袖都不愿承担因让陈平骨灰回国而产生的政治风险，政府高层领袖罕见地纷纷表态。首相纳吉指出，政府不会允许前马共总书记陈平的遗体运回大马安葬，也不允许其骨灰运回国，因陈平代表“历史的黑暗面”。内政部长阿末扎希表示，虽然陈平已死，但难以消弭跟马共作战的殉职军警家属恨意。他说：“人们不应忘记陈平是马共武装分子头目，他追求建立共产主义国家的行动导致成千上万的保安人员丧命及家属痛失亲人，保安部队无法原谅他的行动。”国防部长希山慕丁指陈平曾经领导马共，须对数以千计捍卫国家主权的士兵、保安部队人员以及人民的丧命负起全责。他说：“历史证明陈平生前的所作所为，已在大马人民引起许多不安和混乱。”总警长卡立则指陈平并非大马公民，因此他看不出有什么理由应让陈平的骨灰安葬在大马。
