马英九希望台日渔业协议作例子，也与中国大陆达成合作开发东海资源的协议。

　　他说，国家主权不分能割但资源可以共享，所以首先专注在共同开发、共同利用与管理资源之上，这可发展出互信关系，最终可带领找到解决主权问题的方法。这方法在台日关系上已明显生效，希望能扩展这个例子，与其他利害关系国也作类似协商，因此希望能与中国大陆达成共同开发东海的协议，共同进行海事协商与石油等资源开发。

　　马英九表示，因为台日确实在双方的协商上是有基础的，希望依此基础进一步发展，这也是降低东海情势的方法；尤其台湾要扮演和平缔造者的角色，降低两岸紧张情势，也试着降低台日之间在渔业方面的纷争，因此渔业协议大受渔民欢迎，日本态度也一样，虽然东海和平还有很长的路要走，但这开头还不错。