1980年代，胡耀邦任总书记后第一次访问日本，在某个场合的讲话稿交由王毅来起草，当时他还是外交部亚洲司的一个科员。这篇讲稿，胡耀邦只修改了两处，还在稿子上写了个批语：“此稿写得很好！”
《环球人物》还报道称，王毅与外交有着另外一个缘分，他是知名外交家钱嘉东的女婿。钱嘉东曾任周恩来的外事秘书，后来担任过中国常驻联合国日内瓦代表团大使，现退休在家。
在工作上，王毅很好强，“他和别人在一起工作，一定要想方设法比别人强一点。”孙杰强说，他人很正，不会干出圈的事。
热爱学习的王毅在工作后继续深造。1996年，时为外交部亚洲司司长的王毅在南开大学APEC研究中心读在职硕士研究生，1998年4月获世界经济专业经济学硕士学位。
1999年9月起，王毅在外交学院攻读国际关系专业的博士学位。“从组织关系上来说，他是我们的领导（外交部部长助理），但是在我们面前，他对老师是很尊敬的，完完全全把自己作为一个普通的学生。”外交学院教授周尊南对《博客天下》说，他当时为王毅讲授《现代国际关系史》。
去年5月，“好学生”王毅陪同国务院总理李克强出访德国时，参观了波茨坦会议旧址。当时，李克强强调，“不允许破坏、否认战后的胜利果实”。次日，日本内阁官房长官菅义伟称“中国领导人的讲话无视历史”，王毅一句让日本“老老实实做一回学生，重新看看《波茨坦公告》和《开罗宣言》”，就把对方顶了回去。
作为厅局级博士生，王毅上课很低调。有时候工作太忙，没办法来学校上课，他就会请一起读博的同学把老师授课的内容录下来，再传给他。老师推荐的参考书，他也是通过同学了解。“他不像有的官员，叫自己的秘书去听，从来没有。”周尊南说。
由于工作忙碌，自1999年注册读博以来，王毅至今没能抽出时间写博士毕业论文，也就还没拿到博士学位。
王毅大学毕业时，并没有写作论文的要求，只需要翻译一篇原著，北二外教授陈燕生记得“字数要过万”，文笔好的王毅很轻松地完成了。此外，王毅还在《日语学习与研究》上发表过一篇论文《试论日本语的朦胧风格及翻译上的处理》。
《日语学习与研究》至今仍是中国日语学界唯一的核心期刊。
“当时相当轰动，大家都很惊奇。那时该杂志还是季刊，受页数限制，发表的文章是相当有限的。现在日语专业的老师想在这本期刊上发表论文都非常困难。”陈燕生对《博客天下》说。
“我很赞赏的就是这一点，”周尊南说，“他完全可以对付啊。他当时已经是外交部副部长了，完全可以让秘书或者外交部的几个笔杆子凑一篇博士论文，但他没有这样做。”
