系统思维
一是把握改革的关联性。习近平总书记多次强调，改革开放是一个系统工程，我们要在基本确定主要改革举措的基础上，深入研究各领域改革关联性和各项改革举措耦合性，使各项改革举措在政策取向上相互配合、在实施过程中相互促进、在实际成效上相得益彰。经济、政治、文化、社会、生态文明各领域改革和党的建设改革紧密联系、相互交融，任何一个领域的改革都会牵动其他领域，同时也需要其他领域改革密切配合。如果各领域改革不配套，各方面改革措施相互牵扯，全面深化改革就很难推进下去，即使勉强推进，效果也会大打折扣。
二是把握改革的总体性。不谋全局者，不足以谋一域。习近平总书记指出，我们提出全面深化改革的方案，是因为要解决我们面临的突出矛盾和问题，仅仅依靠单个领域、单个层次的改革难以奏效，必须加强顶层设计、整体谋划，增强各项改革的关联性、系统性、协同性。全面深化改革是关系党和国家事业发展全局的重大战略部署，不是某个领域某个方面的单项改革。十八届三中全会的改革决定，包括3大板块、16个部分、60条、300余项改革举措，是一个非常全面的、强调整体性的改革纲领。不同地区、部门和单位，都要从全局看问题，都要看改革举措是否符合全局需要，是否有利于党和国家事业长远发展。改革的系统性要求加强顶层设计和总体规划。中央成立全面深化改革领导小组，正是改革总体性、系统性的重要组织保证。
创新思维
一是改革的理论创新。创新是一个民族进步的灵魂，是一个国家兴旺发达的不竭动力。一个没有创新能力的民族，难以屹立于世界先进民族之林。在激烈的国际竞争中，惟创新者进，惟创新者强，惟创新者胜。理论创新对实践创新具有重大先导作用，全面深化改革必须以理论创新为先导。在宏观理论上，习近平总书记表示，坚持和发展中国特色社会主义是一篇大文章，要继续把这篇大文章写下去。就具体改革而言，十八届三中全会把市场在资源配置中的“基础性作用”修改为“决定性作用”，是一次重大的理论创新，对未来的经济体制改革以及其他方面的改革，将产生重大而深远的影响。
二是改革的实践创新。习近平在就任总书记不久、视察深圳瞻仰邓小平铜像时说，我们将坚定不移推进改革开放，奋力推进改革开放和现代化建设取得新进展、实现新突破、迈上新台阶。全面深化改革，关键要有新的谋划、新的举措。十八届三中全会的决定描绘了全面深化改革的新蓝图、新愿景、新目标，汇集了全面深化改革的新思想、新论断、新举措。这前后相联的6个“新”字，集中反映了此次改革是一次伟大的创新。
