申诉难应
在苟洪波和吴炯被抓之前，关于王立军主政下的重庆市公安局曾广泛设立外讯基地用以刑讯逼供等情况，已经有过大量媒体报道，并在多位涉黑犯罪当事人的申诉材料中有所反映。
例如，因非法持有枪支弹药罪获刑三年的重庆市公安局禁毒总队毒品检测鉴定中心原主任张继超在申诉材料中称，他在“091基地”——重庆市沙坪坝公园的榕湖宾馆内被刑讯逼供，因为头戴黑套、坐在铁椅上14天后，导致其双腿浮肿、尾椎处皮肤溃烂。
2013年5月，重庆市公安局刑警总队民警聂奎申诉成功，获改判无罪。之前，聂奎因卷入重庆万贯财务咨询有限公司负责人陈坤志案而被抓，后以非法持有枪支弹药罪被判刑八个月，基本上等于被羁押时间，即“关多久判多久”。和聂奎一样，因为卷入他案后因涉黑获刑，最后再审获改判的还有几起，如重庆渝强实业(集团)有限公司董事长黎强案中被判处拘禁五个月的重庆市信访办来访二处原处长姜春燕，也于2013年上半年改判无罪。
但有关刑讯逼供、炮制冤案等内容，无一例出现在王立军案的审判过程中。今年10月25日，中央政治局原委员、重庆市委原书记薄熙来案二审维持原判，获无期徒刑。至此，因2012年2月6日重庆市原副市长王立军叛逃事件引发的重庆“薄王事件”告一段落。
与薄熙来和王立军审判同步进行的，是二人主导的“打黑”运动中获刑入狱的众多当事人的申诉。其中包括黎强涉黑案、原重庆银钢集团销售公司总经理龚刚模涉黑案，以及曾担任龚刚模辩护人的律师李庄案等，都已经向重庆市高级法院提出申诉，不过至今为止，相关涉黑案的主要当事人仍无一例获得正式启动再审程序。
其中，关于李庄案，重庆市公检法联合组成的调查组曾经先后访谈该案当事人和证人，第五巡视组在重庆期间也曾约谈过李庄，但该案是否以及何时启动仍然有待法院说明。
与此同时，许多案件的申诉已被驳回。比如，重庆今普食品有限公司原董事长王天伦涉黑案，已于2013年4月被重庆市高级法院驳回。法院在驳回申诉通知书中认为，以王天伦为首的犯罪团伙具有黑社会性质组织特征，原判决并无不当。
