一个客观、公正的民调对其资金来源、调查方法、结果处理等内容必须公开透明，让外界了解当中是否存在利益冲突。不过，港大的“钟氏民调”却一直对其资金来源讳莫如深，过去曾多次被揭发收取外国的资金进行有关选举、政制等敏感议题的民调。
在去年七一游行前夕，钟庭耀举行所谓“全民公投”计划，并提早数月向外界筹款，但社会反应冷淡，4个月的筹款期内，只收到11,650元市民和网民的捐款，日均不足100元。本来在缺乏资源之下，“全民公投”将会胎死腹中。不过在5月22日，捐款增幅突然达到80万元，总筹款额为811,650元，超过了既定目标。而钟庭耀对于这笔神秘捐款的来歷一直没有向外界透露。
2012年9月立法会选举前夕，钟庭耀就各区候选人的支持率做相关民调，期间有传媒爆料，指钟庭耀拿到了由美国全国民主基金会提供数十万港元的大额捐款。而最终的选举结果与钟庭耀的民调之间存在多项严重误差，不仅经常严重错估选举结果，甚至连最基本的得票率，也与实际情况相距甚远。
2008年立法会选举时，“钟氏民调”又被传媒揭发收取“英国网络观察基金会”给予的5万英镑进行民调。根据资料显示，成立于1996年的英国网络观察基金会是一个互联网自律协会，负责监督英国互联网上的有害信息并汇总，性质与“钟氏民调”毫不相关，却大手笔贊助逾60万港元给钟庭耀，被质疑贊助另有目的。
在2004年立法会选举中，钟庭耀更直承接受全美民主基金会（NED）及下属“全国民主学会”（NDI）的资助。钟庭耀当时向传媒承认，曾于2003年底接受NDI贊助，进行政党发展调查，显示钟庭耀的部分调查经费是来自NED及NDI。根据资料显示，美国中央情报局（CIA）的职能之一，是从事颠覆别国政权活动的财政资助，由于声名狼藉，这笔基金变成由“中情局分店”的NED负责。不禁令人质疑，钟庭耀在NED及下属NDI资助下进行的民意调查，难有学术性和独立性可言。