“木斯塘计划”
中央情报局眼看西藏境内的叛乱武装已无生存基础，腹地渗透死路一条，于是又将计划改为从境外进行长期袭扰。1960年前后，中央情报局和西藏分裂势力决定寻求一个新的安全活动基地，由于印度不愿为其提供基地，他们将活动基地从西藏境内转移到尼泊尔。经过一番挑选，他们看中了尼泊尔境内半独立的封建领地木斯塘。木斯塘一带山高林密，地方首领信喇嘛教并不受政府管辖，况且紧邻西藏边境，进行渗透行动十分方便。不过当地人烟稀少，一切物资供应均要靠美国解决。
1960年9月，达赖集团在木斯塘重新组建了“四水六岗卫教军”，由此开始了在中国边境长达十年之久的军事袭扰。其首任总指挥贡布扎西在回忆录中写道，“有时，一二百人的西藏游击队的活动深入中国占领区达100英里”。然而，美国人后来承认：“这些袭击除了给西藏部队以暂时的满足，并激起他们有朝一日真正进军故乡的希望外，作用几近于零”。
不过有一次，这种袭击行动却出乎意料地获得了大量情报。西藏叛乱分子在一条冷僻的山路上，伏击了中国人民解放军一支小小的车队，他们在一辆车上发现了几个邮袋，里面除了一般日常函件外，还有从北京发出的政府官方文件和军事文件。叛乱分子把邮袋交给了中央情报局。后来，中央情报局总部的中国问题专家仔细分析了邮袋的内容，从中发现了中国官方大量有关西藏情况的数据与资料。
除此之处，“西藏行动”未能获得任何其他值得一提的收获，却继续有气无力地在原地踏步。
1960年5月，一架美国U一2飞机进入苏联领空进行侦察时被击落，此后，艾森豪威尔总统下令停止入侵共产党国家领空，这包括西藏在内。到1960年底中央情报局取消了对西藏叛军的空投，失去物资供应的叛军不得不独自面临一个苦冬，许多人因为没有食物和住所而冻饿而死，还有一些人被迫吃皮鞋和皮革来维持生命。
1961年3月，新上台的肯尼迪总统重新批准了中央情报局的秘密计划，于是，中央情报局又开始向木斯塘的叛军空投武器、无线电操作员、装备和生活必需品。
中央情报局给叛军下达的任务是，进攻解放军分散的营地，并在拉萨至新疆的交通干线上破坏运输。这些袭扰行动，迫使中国在该地区增加兵力，并将西藏西部的交通线改道为青海至新疆的公路。
当中央情报局决定继续空投时，遭到了印度的反对。印度国防部长杜特向美国表示：“为了加强中印边境的防空，坚决击落任何侵犯印度领空的飞机，因而希望美国的飞机在将来的空投中不要飞越印度领空，也不希望美国利用西藏人在印度反对中国，而使问题复杂化。”没有印度的支持，“木斯塘计划”暂时搁浅。
然而1962秋天，中国和印度爆发了一场短暂的边境战争，从而导致印度政府的态度发生了明显变化。在对待美国中央情报局利用印度领土(领空)援助达赖集团分裂活动的立场和行动上，印度由原来的反对者(至少是中立者)变成了主要的积极参与者。而且印度开始与美国在军事上积极合作，美国向印度提供军事援助，而印度获得该项援助的条件之一是“与美国合作共同遏制共产党中国”。军事合作促使美、印两国在情报领域展开了合作。美国中央情报局远东地区负责人菲兹格拉德和印度中央情报局局长穆立克分别为合作双方的代表。从此，美国中央情报局与印度情报局在援助西藏分裂势力行动上展开了密切合作。
美国和印度在“西藏计划”中各取所需。美国的目的在于抵抗所谓“共产党中国在印度与南亚的扩张”，具体行动是通过藏人游击行动收集解放军在西藏地区军事部署的情报。印度在“西藏计划”中的具体目标是利用藏人游击队对抗中国边境的防务力量，以期巩固其“东北边境特区”(NEFA)的安全。12月，印度情报局实施“察克拉塔计划”。依据该计划，这些藏人将被组建为“特别边境部队”(Special Frontier Force，简称SFF)，他们的任务是收集中国情报和实施其他准军事行动。美国中央情报局极力配合印度情报局的“察克拉塔计划”。除了为“特别边境部队”提供辅助性训练、跳伞技术外，美国中央情报局还派出由106人组成的特种部队为其提供“秘密的”游击战术和非常规战术训练。
同时，美、印两国情报局还将受训的藏人间谍派往西藏和中印边境实施侦察活动。他们通过跳伞进入西藏内地建立了20个情报站，其任务是侦察中国军队的集结动向；安装传感器，用于侦察中国核试验及导弹试验；截取中国军事通讯的信息。
1963年11月，美国中央情报局与印度情报局在新德里成立新的联合行动机构——“特别中心”。“特别中心”的主要职能是利用西藏分裂分子向中国西藏渗透间谍。他们的主要任务是深入西藏及中印边境地区，用无线电收集并发送关于中国西藏的社会、政治、军事情报。美国中央情报局为其提供耐用型太阳能无线电电台。
