事件发生后，大陆海协紧急致函台湾海基会，请其转告台湾有关方面：1、保证该机旅客、机组人员及飞机的安全； 2、由该机机组人员驾机于下午返回厦门，请台湾有关方面给予必要的协助；3、尽快遣返劫机犯。
台湾方面在下午1点作出人机分离的处理决定，并对其他乘客提供服务和中转第三地飞行的几点决议。
为了了解劫机者的动机及行为，台湾方面迅速将袁斌夫妇带出紧急侦讯，并对相关人员进行侦讯，包括9名机组人员和10名乘客。侦讯的过程在下午2点30分左右大致结束，2点40分，经过有关方面确认后的正驾驶文飞和副驾驶廖向农在机场地勤人员的陪同下，下机一一检视飞机的轮胎、飞机外观等，作起飞准备。台湾“中华航空公司”则为飞机加油、为机上旅客提供饮料和食品。
18点零3分，这架飞机从中正机场起飞，19点18分在厦门高崎国际机场安全降落，稍作休整后，飞机再度起飞，于当晚23点35分平安飞抵昆明。本来从北京到昆明只需3个小时左右，但是CA905的旅客们却花了整整16个小时。
劫机者私欲膨胀
劫机者袁斌、徐梅夫妇两人的年龄都不大。袁斌1968年11月7日出生，再过几天才满30周岁，航校毕业，在国航任职5年，刚取得波音正驾驶资格，是国航最年轻的机长之一，可谓年轻有为，每月收入也在1万元左右；徐梅1971 年3月13日出生，今年刚满27岁，在北京某小学教书。他们两人各自都有令人羡慕的工作，可为什么会做出这等劫机的事来呢？据说是为了分房。正在开会研究袁斌劫机案的国航飞行总队赵书记告诉记者，袁斌曾于1996年分得光熙门北里27 号楼207房两居室一套，按排队分房，他明年又能分到新房。温副书记和李副总队长也持这种看法。杨副总队长则颇为义愤地说袁斌是“个人私欲膨胀”，“想要更多的房”，不可能满足他。
袁斌和徐梅从今年10月5日起，就在家中密谋劫机到台湾。据说，他们还卖掉了自己的汽车。袁斌称与其夫人商量劫机，其夫人徐梅并不赞同，但因他十分坚持，徐梅只好同意收拾行李随他同行。
